从clogit运行Dredge模型子集

时间:2014-04-03 19:47:22

标签: r survival-analysis model-comparison

我正在尝试在我的完整模型clogit(来自包survival)上运行挖泥机,但每次尝试时R都会不停地崩溃。我刚收到一条错误消息," R遇到致命错误。会议终止了。"

library(survival)
FullModel <- clogit(OBSERVED ~ Canopy + distgr_sca + Near_Hwy3 + strata(PID1), Compiled)
library(MuMIn)
dredge(FullModel)

这是我的代码。关于为什么会崩溃的任何想法,或者我可以采用其他方式在我的模型上运行完整的挖泥机?

谢谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

当模型公式中未指定 strata clogit是唯一的模型术语时,

strata()似乎会崩溃R.您需要告诉dredge在所有模型中保留strata(PID1),并将子集限制为最少3个变量:

dredge(fm0, eval = T, fixed = "strata(id)", m.min = 3)

可重复的例子:

library(survival)
library(MuMIn)

## from example(clogit)
resp <- levels(logan$occupation)
n <- nrow(logan)
indx <- rep(1:n, length(resp))
logan2 <- data.frame(logan[indx,], id = indx, tocc = factor(rep(resp, each=n)))
logan2$case <- (logan2$occupation == logan2$tocc)
fm <- clogit(case ~ tocc + tocc:education + strata(id), logan2, na.action = "na.fail")
##

dredge(fm, fixed = "strata(id)", m.min = 3)