我需要使用MATLAB为我的系统生物学课程模拟基因的负,正和简单调控。问题在于负调节和简单调节功能起作用,而正调节功能仅输出零。
我的脚本如下:
% Simulation of simple regulation, negative autoregulation and positive
% autoregulation
% Define constants
global a b K n
a = 1;
b = 1;
K = 0.5;
n = 2; % Hill coefficient
% Simulation time
tspan = [0,10];
% Initial condition
X0 = 0;
% Run simulations
[t1,X1] = ode45(@autoregulation_f0,tspan,X0); % Simple regulation
[t2,X2] = ode45(@autoregulation_f1,tspan,X0); % Negative autoregulation
[t3,X3] = ode23(@autoregulation_f2,tspan,X0); % Positive autoregulation
% Plot results
figure;
plot(t1,X1,t2,X2,t3,X3);
legend('simple','negative','Location','southeast');
我的功能是:
function dxdt = autoregulation_f0(t,X)
global a b
dxdt = b - a*X;
end
function dxdt = autoregulation_f1(t,X)
global a b K n
dxdt = b/(1+(X^n)/(K^n)) - a*X;
end
function dxdt = autoregulation_f2(t,X)
global a b K n
dxdt = b*X.^n./(K.^n+X.^n) + a*X;
end
第三个函数“ autoregulation_f2(t,X)”是一个输出零的函数,因此在绘制图形时,我只会得到一条直线。
有人知道这是什么原因吗?
谢谢!
答案 0 :(得分:0)
对于给定的功能,它看起来是正确的结果。您提供的dxdt
在每个学期中都有一个X
。初始的X0=0
将产生dxdt=0
,而您在X
中没有任何变化。结果,您只得到一条平线。