这是我第一次在这里发布内容。我正在尝试删除numba jitclass内numpy数组内的行。我编写了以下代码以删除任何包含3的行:
>>> a = np.array([[1,2,3,4],[5,6,7,8]])
>>> a
>>> array([[1, 2, 3, 4],
[5, 6, 7, 8]])
>>> i = np.where(a==3)
>>> i
>>> (array([0]), array([2]))
我无法使用numpy.delete()函数,因为numba不支持该函数,并且无法将None类型的值分配给该行。我所能做的就是通过以下方式将0分配给该行:
>>> a[i[0]] = 0
>>> a
>>> array([[0, 0, 0, 0],
[5, 6, 7, 8]])
但是我想完全删除该行。
任何帮助将不胜感激。
非常感谢您。
答案 0 :(得分:1)
这实际上不是一件容易的事,因为numba具有以下限制:
np.delete
axis
和np.all
中的np.any
关键字np.zeros(shape, dtype=np.bool)
或类似功能直接创建防毒面具但是您仍然可以采用几种方法来解决问题。我测试了一些,创建一个布尔型掩码似乎是最快,最干净的方法。
@nb.njit
def delete_workaround(arr, num):
mask = np.zeros(arr.shape[0], dtype=np.int64) == 0
mask[np.where(arr == num)[0]] = False
return arr[mask]
a = np.array([[1,2,3,4],[5,6,7,8]])
delete_workaround(a, 3)
即使仅返回一行或一个空数组,该解决方案也具有保留数组尺寸的巨大优势。这对于jitclass非常重要,因为jitclass严重依赖固定尺寸。
根据您的要求,我将向您展示一种将数组转换为列表然后返回的解决方案。由于numba中的所有python方法尚不支持反射列表,因此您必须对函数的某些部分使用包装器:
@nb.njit
def delete_lrow(arr_list, num):
idx_list = []
for i in range(len(arr_list)):
if (arr_list[i] != num).all():
idx_list.append(i)
res_list = [arr_list[i] for i in idx_list]
return res_list
def wrap_list_del(arr, num):
arr_list = list(arr)
return np.array(delete_lrow(arr_list, num))
arr = np.array([[1,2,3,4],[5,6,7,8],[10,11,5,13],[10,11,3,13],[10,11,99,13]])
arr2 = np.random.randint(0, 256, 100000*4).reshape(-1, 4)
%timeit delete_workaround(arr, 3)
# 1.36 µs ± 128 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000000 loops each)
%timeit wrap_list_del(arr, 3)
# 69.3 µs ± 4.97 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10000 loops each)
%timeit delete_workaround(arr2, 3)
# 1.9 ms ± 68.9 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
%timeit wrap_list_del(arr2, 3)
# 1.05 s ± 103 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
因此,如果您已经拥有数组(即使您还没有数组,但是您的数据是一致的类型),则坚持使用数组对于小型数组的速度大约快50倍,对于大型数组的速度大约快 550倍数组。
这是要记住的东西:Numpy数组用于处理数字数据! Numpy经过严格优化,可用于数字数据!如果数据类型(dtype
)是常量并且没有任何超特殊要求(我几乎从未遇到过这种情况),那么将数字数据数组转换为另一种“格式”绝对没有用。 br />
对于numba优化代码尤其如此! Numba在很大程度上依赖于numpy和常量dtypes
/ shapes等。如果要使用jitclass,则更多。
答案 1 :(得分:0)
欢迎来到Stacoverflow。您可以简单地使用数组切片来仅选择其中没有3行的行。
下面的代码有点精巧,基本上可以为您覆盖更多详细信息,尽管您可以使用更短的版本并删除不必要的行。密钥分配为rows_final = [x for x in range(a.shape[0]) if x not in rows3]
import numpy as np
a = np.array([[1,2,3,4],[5,6,7,8],[10,11,3,13]])
ind = np.argwhere(a==3)
rows3 = ind[0]
cols3 = ind[1]
print ("Initial Array: \n", a)
print()
print("rows, cols of a==3 : ", rows3, cols3)
rows_final = [x for x in range(a.shape[0]) if x not in rows3]
a_final = a[rows_final,:]
print()
print ("Final Rows: \n", rows_final)
print ("Final Array: \n", a_final)
Initial Array:
[[ 1 2 3 4]
[ 5 6 7 8]
[10 11 3 13]]
rows, cols of a==3 : [0 2] [2 2]
Final Rows:
[1]
Final Array:
[[5 6 7 8]]
答案 2 :(得分:-2)
我认为您需要再次将删除分配给变量a,这对我来说很有效。尝试以下代码:
import numpy as np
a = np.array([[1,2,3,4],[5,6,7,8]])
print(a)
i = np.where(a==3)
a=np.delete(a, i, 0) # assign it back to the variable
print(a)