R - 更改corrplot的轴标签大小

时间:2011-03-19 02:26:27

标签: r plot font-size correlation r-corrplot

我在corrplo t:

中使用以下内容
require("corrplot") ## needs the corrplot package
corrplot(cor(lpp_axis1, lpp_axis2), method=c("number"), bg = "grey10",
         addgrid.col = "gray50", tl.offset = 2, tl.cex=2,
         tl.col = "black", 
         col = colorRampPalette(c("yellow","green","navyblue"))(100))

这是使用csv文件here创建的。

图表很好,我可以调整cl标签。我试过调整x和y轴上的标签没有任何影响。我看着改变马克 - 但我还没找到办法。尝试使用cex.label来改变大小,我没有成功。

问题 - 如何使文本出现在corrplot(不是cl,而不是网格)更大?

这两个轴是以下数据框:

lpp_axis1 <- data.frame("Compile Source Code" = Q3A.1, "View Source Code" = Q3A.2, "Change Source Code" = Q3A.3, "Write Documentation" = Q3A.8, "File Bug Reports"= Q3B.3, "Ask Questions" = Q3B.5, "Provide Answers" = Q3B.6, "Overall Participation" = Q3a3bConsolidated)

lpp_axis2 <- data.frame("Identification" = Q1,"Overall Learning" = Q6Consolidated,  "Learning Programming" = Q6.1,  "Learning about Computers" = Q6.2, "Learning Teamwork" =  Q6.3)

的输出
str(lpp_axis1)

> str(lpp_axis1)
'data.frame':   4603 obs. of  8 variables:
 $ Compile.Source.Code  : int  4 2 3 2 2 2 3 2 2 0 ...
 $ View.Source.Code     : int  4 2 1 1 2 2 3 1 1 0 ...
 $ Change.Source.Code   : int  4 1 0 1 2 1 2 1 1 0 ...
 $ Write.Documentation  : int  4 1 2 2 3 0 3 0 1 0 ...
 $ File.Bug.Reports     : int  4 4 1 2 2 0 2 0 0 0 ...
 $ Ask.Questions        : int  4 4 2 4 2 1 2 1 3 0 ...
 $ Provide.Answers      : int  2 4 1 4 4 0 3 1 3 0 ...
 $ Overall.Participation: int  49 26 14 32 31 8 27 10 15 0 ...

的输出
packageDescription("corrplot")

表示:

Package: corrplot
Type: Package
Title: visualization of a correlation matrix
Version: 0.30
Date: 2010-05-30
Author: Taiyun Wei
Suggests: seriation, cairoDevice, Cairo,
Maintainer: Taiyun Wei <weitaiyun@gmail.com>
Description: The corrplot package is a graphical display of a
        correlation matrix, confidence interval. It also contains some
        algorithms to do matrix reordering.
License: GPL-2 | GPL-3
LazyLoad: yes
URL: http://corrplot.r-forge.r-project.org
Repository: CRAN
Repository/R-Forge/Project: corrplot
Repository/R-Forge/Revision: 45
Date/Publication: 2010-05-31 07:44:14
Packaged: 2010-05-30 20:39:16 UTC; rforge
Built: R 2.11.1; ; 2011-03-19 00:22:49 UTC; unix

-- File: /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.11/corrplot/Meta/package.rds 
> 

corrplot维护者使用备用corrplot.r回复了here

使用此corrplot和下面的示例代码,文本大小是可以接受的。但是,增加它的尝试也会产生相同的效果。

source("http://misterdavis.org/R_info/corrplot.r")
corrplot(cor(lpp_axis1, lpp_axis2), addn=T,
         addgrid.col = "gray50", tl.cex=2, assign.col="min2max",
         tl.col = "black", cl.ratio=0.4, addcolor="no",
         col = colorRampPalette(c("yellow","green","blue"))(100))

使用早期版本的可用关联圈here,可以根据自己的心愿调整文本。 (虽然该图缺少后来更精确的corrplot包的一些功能。)cex可用于cex。在时间允许的情况下,我可能会尝试调整两者以提出一个快乐的媒介。

使用较旧的相关圆圈脚本,以下代码生成足够大的X和Y轴标签:

circle.corr(cor(lpp_axis1, lpp_axis2), bg = "gray50",   col = colorRampPalette(c("navyblue","white", "red"))(100), cex=1.5)

3 个答案:

答案 0 :(得分:11)

<强> UPDATE2

实际上,由于提供了代码和数据,现在是一个真正可重复的例子:

d1 <- read.csv(url("http://misterdavis.org/r_wiki/r_results_1231_2010"))
lpp_axis1 <- with(d1, data.frame("Compile Source Code" = Q3A.1,
                                 "View Source Code" = Q3A.2,
                                 "Change Source Code" = Q3A.3, 
                                 "Write Documentation" = Q3A.8, 
                                 "File Bug Reports"= Q3B.3,
                                 "Ask Questions" = Q3B.5,
                                 "Provide Answers" = Q3B.6,
                                 "Overall Participation" = Q3a3bConsolidated))

lpp_axis2 <- with(d1, data.frame("Identification" = Q1,
                                 "Overall Learning" = Q6Consolidated,  
                                 "Learning Programming" = Q6.1,
                                 "Learning about Computers" = Q6.2, 
                                 "Learning Teamwork" =  Q6.3))

corrplot(cor(lpp_axis1, lpp_axis2), method=c("number"), bg = "grey10",
         addgrid.col = "gray50", tl.cex=1,
         tl.col = "black", 
         col = colorRampPalette(c("yellow","green","navyblue"))(100))
dev.new()
corrplot(cor(lpp_axis1, lpp_axis2), method=c("number"), bg = "grey10",
         addgrid.col = "gray50", tl.cex=2,
         tl.col = "black", 
         col = colorRampPalette(c("yellow","green","navyblue"))(100))

dev.new()允许您同时在屏幕上进行比较,而不会将绘图区域分成两个面板。

tl.offset似乎造成的问题多于它的价值,所以我把它排除在外。我在下面列出了两个数字:

使用tl.cex = 1

corrplot with tl.cex = 1

使用tl.cex = 2

corrplot with tl.cex = 2

正如您所看到的,我无法重现您所看到的问题; tl.cex仅更改轴标签大小。请注意,这不使用tl.offset,但其余的绘图代码与您的相同。

这是我从packageDescription()得到的:

R> packageDescription("corrplot")
Package: corrplot
Type: Package
Title: visualization of a correlation matrix
Version: 0.30
Date: 2010-05-30
Author: Taiyun Wei
Suggests: seriation, cairoDevice, Cairo,
Maintainer: Taiyun Wei <weitaiyun@gmail.com>
Description: The corrplot package is a graphical display of a
        correlation matrix, confidence interval. It also contains some
        algorithms to do matrix reordering.
License: GPL-2 | GPL-3
LazyLoad: yes
URL: http://corrplot.r-forge.r-project.org
Repository: CRAN
Repository/R-Forge/Project: corrplot
Repository/R-Forge/Revision: 45
Date/Publication: 2010-05-31 07:44:14
Packaged: 2010-05-30 20:39:16 UTC; rforge
Built: R 2.13.0; ; 2011-04-01 12:33:21 UTC; unix

- 文件:/home/gavin/R/libs/corrplot/Meta/package.rds

将它与您系统上的那个进行比较并尝试上面的示例,以便我们运行完全相同的代码进行比较。


原始示例 这是一个可重复的例子:

require(corrplot)
data(mtcars)
corr <- cor(mtcars)
corrplot(corr, method = "number", tl.cex = 2)

<强>更新

好的,我现在看到了问题。使用tl.offset,您可以将标签从相关图形中进一步推出边距。这似乎是corrplot()中的一个错误,就好像你没有设置tl.offset它会缩放相关图形来容纳标签。我能看到的唯一解决方案是根本不设置tl.offset,或者将其设置为较小的值这是一个极端的例子:

layout(matrix(1:2, ncol = 2))
corrplot(corr, method = "number", tl.cex = 2, tl.offset = 3)
corrplot(corr, method = "number", tl.cex = 2)
layout(1)

corrplot 4

可以通过改变绘图设备的相对尺寸来改进 - 如果在屏幕上,增加绘图设备窗口的宽度或高度(或两者),直到所有标签都可见。如果这是另一台设备(pdf()png()说),则您需要在创建时更改设备的尺寸。


原始 [可重现的例子]给出了:

mtcars correlation plot

您不清楚x和y轴标签的问题,但corrplot()会改变绘图边距以容纳标签。您已通过设置参数tl.cex = 2说明了这些x和y轴标签的相对大小。如果您希望标签更大,请增加此值:

corrplot(corr, method = "number", tl.cex = 4)

mtcars correlation plot 2

如果您想要较小的标签,请将tl.cex设置为较小的值:

corrplot(corr, method = "number", tl.cex = 0.8)

mtcars correlation plot 3

鉴于这些是图中唯一的x y标签,这有帮助吗?如果没有,哪些标签需要更改?

答案 1 :(得分:2)

您可以尝试使用参数更改文本的磅值。我认为默认大小是12  在par( ps=14)之前添加corrplot之类的行应该会使文字更大。

答案 2 :(得分:2)

根据您添加的示例,您可能需要增加绘图的尺寸并设置外边距以适应标签的长度。

可以使用par()$pin访问当前的绘图维度,使用par()$omi访问外边距。

您可以通过调整以下示例来更改绘图尺寸和外边距:

require("corrplot")         ## needs the corrplot package  
data(mtcars)  
  corr <- cor(mtcars)    
par(pin=c(7,7))              ##  (width, height) in inches    
par(omi=c(0,1,1,0.5))        ## (bottom, left, top, right)  in inches  
corrplot(corr, method="number", tl.cex = 2)

enter image description here