从R中的多个列表中生成二进制(存在/不存在)数据矩阵

时间:2018-12-01 21:33:18

标签: r dataframe matrix binary heatmap

我有一系列不同长度的独立变量列表(字符串)。我想将它们组合到一个数据帧中,以创建一个状态(1)/不存在(0)矩阵。鉴于它们的长度不同,我什至不知道如何创建初始数据帧。这是我的示例:

render() {
    const { company, date, position, image, id } = this.props
    return (
      <Router>
        <Card data-cy="JobCard" to={`/jobs/${id}`}>
          <Image src={image} />
          <Position>{position}</Position>
          <Company>{company}</Company>
          <Date>
            <Moment format="D MMM">{date}</Moment>
          </Date>
        </Card>
      </Router>
    )
  }

我的最终结果是,我想创建一个如下所示的二进制存在/不存在矩阵,以便创建一个图形(类似于热图)来显示该图形。

data1 <- c("a", "b", "c", "d", "e", "f")
data2 <- c("e", "f", "g")
data3 <- c("a", "c", "g")

我对R还是很陌生,所以希望我的解释还可以。感谢您的帮助。

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

splitstackshape程序包中有一个名为charMat的帮助程序功能,您可能想试试

dat <- paste0("data", 1:3)
out <- t(splitstackshape:::charMat(listOfValues = mget(dat), fill = 0L))
colnames(out) <- dat
out
#  data1 data2 data3
#a     1     0     1
#b     1     0     0
#c     1     0     1
#d     1     0     0
#e     1     1     0
#f     1     1     0
#g     0     1     1

数据

data1 <- c("a", "b", "c", "d", "e", "f")
data2 <- c("e", "f", "g")
data3 <- c("a", "c", "g")

说明

该函数期望list作为第一个参数。我们可以使用mget创建该列表

mget(dat)
#$data1
#[1] "a" "b" "c" "d" "e" "f"

#$data2
#[1] "e" "f" "g"

#$data3
#[1] "a" "c" "g"

其中dat是一个包含输入数据名称的字符向量

dat
#[1] "data1" "data2" "data3"

t用于转置charMat的输出。

希望这会有所帮助。

答案 1 :(得分:0)

我将使用%in%来执行此操作,如果存在或不存在值,则返回一个逻辑向量。稍后,我们使用as.integer将逻辑值转换为0和1。

# create a master list
master_list <- unique(c(data1, data2, data3))

# make sure each list is as long as master to avoid,
# this error : longer object length is not a multiple of shorter object length
# adding 'll' just a random value
data1 <- c(data1, rep('ll', length(master_list) - length(data1)))
data2 <- c(data2, rep('ll', length(master_list) - length(data2)))
data3 <- c(data3, rep('ll', length(master_list) - length(data3)))

# create output matrix
mat <- matrix(c(as.integer(master_list %in% data1),
            as.integer(master_list %in% data2),
            as.integer(master_list %in% data3)),
            nrow = length(master_list), 
            dimnames = list(master_list))

  [,1] [,2] [,3]
a    1    0    1
b    1    0    0
c    1    0    1
d    1    0    0
e    1    1    0
f    1    1    0
g    0    1    1