在R中执行功能clustal()时出现错误

时间:2018-11-27 16:35:17

标签: r clustal

我是初学者R,我尝试运行命令clustal(sylvia.seq)

我收到以下错误:

sh: clustalw2: command not found
Error in clustal(sylvia.seq) : 
   cannot find executable ‘clustalw2’ on your computer.
  It is recommended that you place the executable of Clustal
  in a directory on the PATH of your computer which is:
/bin
/Library/TeX/texbin
/opt/X11/bin
/sbin
/usr/bin
/usr/local/bin
/usr/sbin
In addition: Warning message:
In system(paste(exec, opts), ignore.stdout = quiet) :
  error in running command

我在另一篇文章中看到了如何在Windows上修复它,但是不幸的是,我正在使用macOS,但我无法使其正常工作。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

我没有权限将文件添加到任何文件夹中,但是 / opt / X11 / bin

所以我在此处添加了内容,现在可以使用了,但是我尝试了其余的方法,但没有做到。