Question

升级到MacOS Mojave（10.14.1）后，对于安装了Java版本“ 1.8.0_102”的R版本3.5.1，我不再能够安装rJava。

我尝试了previous solution for MacOS 10.11，但仍然无法正常工作，出现了此错误：

Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
.onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
 call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
 error: unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/rJava/libs/rJava.so':
 dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-9.jdk/Contents/Home/lib/server/libjvm.dylib
 Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
 Reason: image not found

Answer 1

发布我发现的解决方案以防其他人遇到麻烦-我不太了解为什么这样做或是否正确，因此寻找更好的替代方案！

此issue引至this Apple forum的地方

对于在/ usr / include下的基本系统中查找macOS标头的旧版软件，请安装位于/Library/Developer/CommandLineTools/Packages/macOS_SDK_headers_for_macOS_10.14的软件包文件。 pkg

为此，请打开终端并运行以下命令

cd /Library/Developer/CommandLineTools/Packages/
open macOS_SDK_headers_for_macOS_10.14.pkg

然后按照提示安装软件包。

然后，在终端中，按照上一个答案配置rJava并安装

sudo R CMD javareconf

R -e "install.packages('rJava')"

，它应该安装没有问题。

Answer 2

我遇到了确切的问题。我是通过以下方式解决的：

安装latest version of Java（dmg文件）
在Studio中安装rJava：install.packages（“ rJava”）
在终端中：sudo mv jdk-12.0.1.jdk jdk-11.0.1.jdk

否则，Rstudio中将出现以下错误：

Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
 .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/rJava/libs/rJava.so':
  dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-11.0.1.jdk/Contents/Home/lib/server/libjvm.dylib
  Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
  Reason: image not found

在Rstudio中：library(rJava)
rJava应该已经正确加载。

Answer 3

当我尝试在macO（Mojave版本）中安装“ rJava”时遇到了同样的问题。

以下我执行的解决问题的步骤。

R版本：3.6.1

问题：配置：错误：缺少一个或多个Java工具。 *** JDK不完整！请确保您具有完整的JDK。 JRE还不够。

解决方案：在终端中执行以下命令

$ /usr/libexec/java_home -V

    Matching Java Virtual Machines (1):
        1.8.0_162, x86_64:  "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_221.jdk(your Java version)/Contents/Home

$ export JAVA_HOME=/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_221.jdk/Contents/Home
$ export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH
$ R CMD javareconf
$ R --quiet -e 'install.packages("rJava", type="source", repos="http://cran.us.r-project.org")'

Answer 4

在安装JDK 11.04 LTS之后，我陷入了Mojave上R Studio中的相同错误

R期待Library not loaded: /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-11.0.1.jdk

尽管运行sudo R CMD javareconf，错误仍然存在

因此，我在finder中浏览到/Library/Java/JavaVirtualMachines/并将文件夹"jdk-11.0.4.jdk"重命名为"jdk-11.0.1.jdk"

重新启动R，library(rJava)和library(xlsx)现在都可以工作。

希望这对某人有帮助

在macOS 10.14上rJava安装失败

4 个答案: