Question

我是Shell脚本的新手，所以我需要您的所有帮助才能实现我的目标。我有一个名为input.csv的文件，其中包含如下所示的数据，

G22822 277 OR2
G22822 329 OR9
G22940 286 OR3
G22940 412 OR7
G25365 289 OR3

现在，OR2，OR9，OR3，OR7和OR3也是名称分别为al_or2.cap，{{ 1}}，al_or9.cap，al_or3.cap和al_or7.cap在不同的路径中。这些上限文件中的数据如下所示，

在al_or2.cap中：

al_or3.cap

在al_or9.cap中：

277 ASCII GRP 184578924
102 ASCII GRP 754815923

与所有封顶文件中的数据一样。

如果您看到input.csv（G22822 277 OR2）中的第一行作为数据提及，我需要转到al_or2.cap并搜索关键字277，并打印G22822和542189353（G22822存在于input.csv中，而542189353存在于al_or2中） .cap）。

然后，对于此G22822 329 OR9，我需要转到al_or9.cap并打印G22822和158203981。

我所需的输出，例如：

981 ASCII GRP 542189353
329 ASCII GRP 158203981

请帮助我实现目标。

Answer 1

假设您提供的数据是准确的，并且不知道您的目录结构，那么这里有一些内容

#!/bin/bash
while read a b c
do
  awk -v a=$a -v b=$b  'b==$1{printf "%s %s\n", a, $4}' tmp/al_$(echo $c | tr '[A-Z]' '[a-z]').cap
done < input.csv

将其保存为karthik.sh，保存了input.csv的前两行，创建了一个子目录tmp，其中包含文件al_or2.cap和al_or9.cap，并运行{{ 1}}我得到以下输出：

./karthik.sh

Answer 2

如果原始文件具有3个字段，而数据文件（例如al_or2.cap等）都具有4个字段，则可以使用一次调用awk和内置函数{ {1}}，tolower，sprintf和getline形成文件名，读取相应的文件并按所需顺序输出结果，如下所示：

split

存在的文件

awk '
{   lwr = tolower($3)
    str = sprintf ("al_%s.cap", lwr)
    while (getline line < str > 0) {
        split (line, a, " ", seps)
        if (a[1] == $2)
            print $1,a[4]
    }
}' file

使用/输出示例

$ cat file
G22822 277 OR2
G22822 329 OR9
G22940 286 OR3
G22940 412 OR7
G25365 289 OR3

$ cat al_or2.cap
277 ASCII GRP 184578924
102 ASCII GRP 754815923

$ cat al_or9.cap
981 ASCII GRP 542189353
329 ASCII GRP 158203981

创建简单的$ awk ' > { lwr = tolower($3) > str = sprintf ("al_%s.cap", lwr) > while (getline line < str > 0) { > split (line, a, " ", seps) > if (a[1] == $2) > print $1,a[4] > } > }' file G22822 184578924 G22822 158203981脚本

如果您要根据以上内容创建awk，则可以执行以下操作：

awk-script

现在您需要做的就是保存文件并使其可执行（例如#!/usr/bin/awk -f { lwr = tolower($3) str = sprintf ("al_%s.cap", lwr) while (getline line < str > 0) { split (line, a, " ", seps) if (a[1] == $2) print $1,a[4] } }，然后

使用/输出示例

chmod +x myscript.awk

我想转到文件并根据文件中存在的文件名和关键字来获取值吗？

2 个答案: