我正在用Seurat对我的scRNAseq数据的特定簇进行基因-基因相关性分析,我想在我的图上添加一条回归线。 这就是我所做的:
TSNEPlot(object = SampleA,do.label=TRUE)
WhichCells(object = SampleA, ident = "2")
SampleA2.subset <- SubsetData(object = SampleA, ident.use = c("2")) #2 is my cluster of interest
GenePlot(YSa2.subset, "Itgam", "Elf1")
我认为我必须使用abline函数,但无法在Seurat中使用它。 有谁遇到过同样的问题,可以为我提供帮助吗?还是有另一种我不知道的方法?
非常感谢您的光临!