将回归线添加到Seurat中的GenePlot中

时间:2018-11-21 14:49:20

标签: r regression line

我正在用Seurat对我的scRNAseq数据的特定簇进行基因-基因相关性分析,我想在我的图上添加一条回归线。 这就是我所做的:

TSNEPlot(object = SampleA,do.label=TRUE) 
WhichCells(object = SampleA, ident = "2")
SampleA2.subset <- SubsetData(object = SampleA, ident.use = c("2")) #2 is my cluster of interest
GenePlot(YSa2.subset, "Itgam", "Elf1")

我认为我必须使用abline函数,但无法在Seurat中使用它。 有谁遇到过同样的问题,可以为我提供帮助吗?还是有另一种我不知道的方法?

非常感谢您的光临!

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