我正在尝试使用nls
函数在R中拟合此非线性模型。
以下是我要拟合的数据:
tab2 = data.frame(n = c(10,100,1000,10000,100000), Time = c(3.989220e-03,
1.994681e-02, 3.311172e-01, 5.142252e+00, 1.314725e+03))
我们看到时间在成倍增长,所以我想用nls
来建模。到目前为止,这是我尝试过的:
mod4 = nls(Time ~ exp(a + b*n), data = tab2, start = list(a = -3, b = 0))
但是,这不起作用,并且出现以下错误消息:
Error in numericDeriv(form[[3L]], names(ind), env) : Missing value or an
infinity produced when evaluating the model
我不知道为什么会这样,但是我想这与这些初始值有关吗?我通过使用lm估计模型来获得它们:
mod3 = lm(log(Time) ~ n, data = tab2); coef(mod3)
(Intercept) n
-2.5908574883 0.0001010623
由于这是几乎相同的模型,所以我认为系数会匹配,但是当我使用接近它们的值作为初始值时,nls
模型将无法工作。
关于为什么发生这种情况的任何建议吗?
答案 0 :(得分:0)
需要更好的起始值。如果我们取双方的对数,则它成为线性模型,任何起始值都应起作用,因此只需使用a = b = 1即可。 (我们可以交替使用lm
。)然后将第一个模型的系数用作原始模型的起始值。
fo1 <- log(Time) ~ a + b*n
fm1 = nls(fo1, data = tab2, start = list(a = 1, b = 1))
fo2 <- Time ~ exp(a + b * n)
fm2 <- nls(fo2, tab2, start = coef(fm1))
fm2
给予:
Nonlinear regression model
model: Time ~ exp(a + b * n)
data: tab2
a b
3.567e-01 6.825e-05
residual sum-of-squares: 10.84
Number of iterations to convergence: 7
Achieved convergence tolerance: 2.051e-06