安装BayesLogit软件包

Question

我正在尝试在R中安装BayesLogit软件包。该软件包已从CRAN网站上删除，但是我具有源文件BayesLogit_0.6.tar.gz。我尝试跑步

install.packages("BayesLogit_0.6.tar.gz", type = "source", repos = NULL)

但出现以下错误：软件包“ BayesLogit_0.6.tar.gz”的安装退出状态为非零。

任何人都可以提供帮助，或者您不能再安装此软件包？我已经将该软件包安装在另一台计算机上，当它在CRAN网站上时又将其重新安装。

Answer 1

我能够使用devtools::install_version("BayesLogit", "0.6")

在Ubuntu计算机上安装软件包

由于该软件包包含C ++源文件，因此您非常需要编译工具。如果使用Windows，则意味着您将需要安装RTools。在Mac上，您将需要Xcode command line tools。另请参见How do I install a package that has been archived from CRAN?和https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/

Answer 2

Linux

在R会话中运行以下命令：

10ee

macOS

从源代码编译BayesLogit需要GFortran，后者需要XCode和命令行工具：

• 从App Store安装XCode，或仅安装命令行工具（例如，从this thread开始）
• 安装install.packages("devtools") # optional, in case you don't have it require(devtools) install_version("BayesLogit", version = "0.6") # the latest version on CRAN archive ，例如使用an appropriate disk image
• 在R中运行与上面相同的代码：

gfortran

替代软件包

GitHub page of BayesLogit的最新更新时间是11个月前，因此我猜测它不会在CRAN上。另一个选择是this package，它实现与install.packages("devtools") # optional, in case you don't have it require(devtools) install_version("BayesLogit", version = "0.6") # the latest version on CRAN archive 相同的Polya-Gamma方案，并且语法非常相似：

BayesLogit

要安装# BayesLogit obj <- BayesLogit::logit(y=y, X=X, P0=diag(rep(precision, ncol(X)), samp=n_samples, burn=burn) # PolyaGamma obj <- PolyaGamma::gibbs_sampler(y=y, X=X, lambda=precision, n_iter_total=burn + n_samples, burn_in=burn) 软件包，请在R会话中运行以下命令：

PolyaGamma