具有clValid函数的模糊C均值聚类

Question

我正在使用clValid软件包中的功能clValid，并使用fanny参数验证我的模糊聚类。

intvalid <- clValid(clust, 2:10, clMethods=c("fanny"),
            validation="internal", metric='euclidean', maxitems = 1000)

但是，我想使用SqEuclidean测试有效性，因此使用模糊C均值聚类而不是模糊聚类。我知道clValid中的fanny算法来自群集程序包。我知道只有三个选项是欧几里得，相关和曼哈顿，因此没有办法将距离设置为SqEuclidean.

如何使用模糊C均值聚类执行clValid？还是我误解了clValid中fanny函数的metric参数？

  

字符串，指定用于计算观察值之间的差异的度量。选项为“ euclidean”（默认），“ manhattan”和“ SqEuclidean”。欧几里得距离是差的平方根，曼哈顿距离是绝对差的和，而平方欧几里得距离“ SqEuclidean”是差的平方和。使用最后一个选项等效于（但速度稍慢）于所谓的“模糊C均值”计算。如果x已经是一个不相似矩阵，则此参数将被忽略。

数据

library(dplyr)
library(cluster)
library(clValid)
df<-iris[,-5] # I do not use iris, but to make reproducible
clust<-sapply(df,scale)