使用Python从OpenDAP批量下载数据

时间:2018-11-15 07:12:35

标签: python python-xarray opendap

我正在尝试从OpenDAP下载多个.nc文件。当我手动下载文件(没有脚本)时,文件将按预期工作。为了加快速度,我有一个脚本可以批量下载数据。但是,当我使用xarray下载数据时,文件大10倍,并且文件似乎已损坏。

我的脚本如下:

import pandas as pd
import xarray as xr
import os
import numpy as np

dates = pd.date_range(start='2016-01-01',end='2016-01-05',freq='D')
my_url = "http://www.ifremer.fr/opendap/cerdap1/ghrsst/l4/saf/odyssea-nrt/data/"

print("  ")
print("Downloading data from OPeNDAP - sit back, relax, this will take a while...")
print("...")
print("...")

# Create a list of url's 
data_url = []
cnt = 0
for i in np.arange(1,5):
    ii = i+1

    data_url.append(my_url + str(dates[cnt].year)+"/"+ str('%03d'%+ii)+"/"\
        +str(dates[cnt+1].year)+str('%02d'%dates[cnt+1].month)+str('%02d'%dates[cnt+1].day)\
        +"-IFR-L4_GHRSST-SSTfnd-ODYSSEA-SAF_002-v2.0-fv1.0.nc?time[0:1:0],lat[0:1:1749],lon[0:1:2249],analysed_sst[0:1:0][0:1:1749][0:1:2249],analysis_error[0:1:0][0:1:1749][0:1:2249],mask[0:1:0][0:1:1749][0:1:2249],sea_ice_fraction[0:1:0][0:1:1749][0:1:2249]")

    cnt = cnt+1

url_list = data_url

# Download data from the url's
count = 0
for data in url_list:
    print('Downloading file:', str(count))
    ds = xr.open_dataset(data,autoclose=True)
    fname = 'SAFodyssea_sst'+str(dates[count+1].year)+str('%02d'%dates[count+1].month)+str('%02d'%dates[count+1].day)+'.nc'
    ds.to_netcdf(fname)
    count = count +1
    del ds, fname

print('DONE !!!')

我有xarray版本0.10.8。我尝试使用python 2.7和python 3.5.6以及在Windows 10和Ubuntu 16.04上运行它,得到的结果相同。

非常感谢您的帮助。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

每个文件都作为netCDF文件的关联URL,例如, http://www.ifremer.fr/opendap/cerdap1/ghrsst/l4/saf/odyssea-nrt/data/2018/001/20180101-IFR-L4_GHRSST-SSTfnd-ODYSSEA-SAF_002-v2.0-fv1.0.nc

解决此问题的一种简单方法是使用库,例如​​请求下载每个文件,例如,如下所述: How to download large file in python with requests.py?