共享外壳程序节

Question

是否可能有2条规则共享同一外壳程序段？ （不重复shell内容） 否则，如何根据一条参数的值编写一条具有不同输入和输出内容的规则？

Answer 1

根据需要根据通配符编写python function to choose input files。您也可以在此示例中使用lambda函数：

rule xxx: 
    input:
        lambda wildcards: "data/A.txt",
                if wildcards.sample == 'voted' \
                else \
                    "data/B.txt",
    output:
        "data/{sample}/done.txt"
    shell:
        "do something"