这是此问题的后续问题:How to set .libPaths (checkpoint) on workers when running parallel computation in R
基于答案,我将以下代码(简化示例)放入了名为“ test1”的R包中:
#' @export
f <- function() {
`%dopar%` <- foreach::`%dopar%`
doFuture::registerDoFuture()
libs <- .libPaths()
res <- foreach::foreach(x = 1:2) %dopar% {
cat(sprintf("Initial Library paths used by worker (PID %d):\n", Sys.getpid()))
cat(sprintf(" - %s\n", sQuote(.libPaths()[1])))
## Use the same library paths as the master R session
.libPaths(libs)
cat(sprintf("Library paths used by worker (PID %d):\n", Sys.getpid()))
cat(sprintf(" - %s\n", sQuote(.libPaths()[1])))
x + g()
}
res
}
g <- function() {
h()
}
h <- function() {
runif(1)
}
然后我打电话给checkpoint::checkpoint("2018-07-24")
并将软件包安装到检查点库中。然后,以下代码会产生此错误:
checkpoint::checkpoint("2018-07-24")
future::plan("multisession")
test1::f()
工作者使用的初始库路径(PID 16880): -'C:/Programme/R-3.5.1/library'
工作者使用的库路径(PID 16880): -'... /。checkpoint / 2018-07-24 / lib / x86_64-w64-mingw32 / 3.5.1'
工作者使用的初始库路径(PID 3916): -'C:/Programme/R-3.5.1/library'
工作者使用的库路径(PID 3916): -'... /。checkpoint / 2018-07-24 / lib / x86_64-w64-mingw32 / 3.5.1'
{中的错误:任务1失败-“找不到函数“ h””
当我在test1:::g()
调用中显式调用foreach
时,它可以工作。有人可以解释一下,为什么我必须在:::
的foreach循环中显式调用我自己的包的函数吗?看来似乎找到了g()
,但找不到h()
吗?