我正在尝试将多波段tif文件(4波段-[蓝色,绿色,红色,红外线])读入xarray,然后在Jupyter笔记本中使用HoloViews显示为RGB。作为参考,我在这里宽松地关注RGB png示例:http://holoviews.org/reference/elements/matplotlib/RGB.html
最终的RGB图像确实显示,但是,我通过使用np.dstack组合DataArrays丢失了x / y坐标尺寸。最终图像中的x / y坐标默认为〜-0.5-+0.5。
我不知如何处理整个过程中的坐标尺寸,或者潜在地如何将原始坐标尺寸应用于最终图像。
{this.state.fields.map((field) => {
return (
<IssueInputRow
labelText={field.name}
key={i} //want this to increment by 1 for each field, starting a 0
handler={this.handler}
/>
);
})}
使用从以上# read .tif
ximg = xarray.open_rasterio('path/to/tif')
print('1.', type(ximg), ximg.coords['x'].values)
# convert to hv.Dataset
r_ds = hv.Dataset(ximg[2,:,:], kdims=['x','y'], vdims='Value')
g_ds = hv.Dataset(ximg[1,:,:], kdims=['x','y'], vdims='Value')
b_ds = hv.Dataset(ximg[0,:,:], kdims=['x','y'], vdims='Value')
print('2.', type(r_ds), r_ds.dimension_values('x'))
# scale to uint8
r = np.squeeze((r_ds.data.to_array().astype(np.float64)/8190)*255).astype('uint8')
g = np.squeeze((g_ds.data.to_array().astype(np.float64)/8190)*255).astype('uint8')
b = np.squeeze((b_ds.data.to_array().astype(np.float64)/8190)*255).astype('uint8')
print('3.', type(r), r.coords['x'].values)
# combine to RGB
dstack = np.dstack([r, g, b]) # lose coordinate dimensions here
print('4.', type(dstack), 'NO COORDS')
rgb = hv.RGB(dstack, kdims=['x','y'])
print('5.', type(rgb), rgb.dimension_values('x'))
1. <class 'xarray.core.dataarray.DataArray'> [557989.5 557992.5 557995.5 ... 563194.5 563197.5 563200.5]
2. <class 'holoviews.core.data.Dataset'> [557989.5 557989.5 557989.5 ... 563200.5 563200.5 563200.5]
3. <class 'xarray.core.dataarray.DataArray'> [557989.5 557992.5 557995.5 ... 563194.5 563197.5 563200.5]
4. <class 'numpy.ndarray'> NO COORDS
5. <class 'holoviews.element.raster.RGB'> [-0.49971231 -0.49971231 -0.49971231 ... 0.49971231 0.49971231
0.49971231]
,r_ds
和g_ds
创建的HoloViews图像显示所需坐标的示例:
答案 0 :(得分:1)
注释中提到的Landsat示例使用data
形式的(xdim, ydim, R, G, B, A)
参数,该参数将所需的x / y坐标应用于图像。
陆地卫星示例:http://datashader.org/topics/landsat.html
rgb = hv.RGB(
(
ximg['x'],
ximg['y'],
r.data[::-1],
g.data[::-1],
b.data[::-1]
),
vdims=list('RGB')
)