Question

如何使用python合并多个.h5文件（但形状相同）？

我有10,000个.h5文件用于3D点云。

它们具有相同的形状。

我想合并（或合并）2000个文件，所以我总共可以有5个大的.h5文件。（例如python中的append（）函数）

我从h5py（http://docs.h5py.org/en/latest/high/group.html）找到了copy（）函数。

但是，我无法将这种方法应用于我的问题。

请参考示例代码或帮助我解决问题。

对不起，我的英语水平很差。

Answer 1

您可以简单地执行以下操作（未经测试但应该可以）：

import h5py

def copy(dest, name):
    g = dest.require_group(name)  # create output group with the name of input file
    def callback(name, node):
        if isinstance(node, h5py.Dataset):  # only copy dataset
            g.create(name, data=node[:])

with h5py.File('out.h5', 'w') as h5_out:
    for f_in in files:
        with h5py.File(f_in, 'r') as h5_in:
                h5_in.visititems(copy(h5_out, f_in))

这将为每个文件创建一个“文件夹”（HDF5组）并递归复制所有内容。

另请参阅：related question。

如何使用python合并多个.h5文件（但形状相同）？

1 个答案: