如何在R中对较大的相异性/距离矩阵进行分块?

时间:2018-10-22 14:13:48

标签: r cluster-analysis hierarchical-clustering euclidean-distance chunking

我想对包含5万行和10个要素/列的混合类型数据进行聚类。我在64位PC上使用R。当我使用“雏菊”函数计算相异度/距离矩阵时,出现“错误:无法分配大小为X GB的向量”错误。

gower_dist <-daisy(df,metric =“ gower”)。

这是生成距离矩阵的命令。如何使用块处理此脚本以避免RAM错误?

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