Spark Python:如何计算RDD中每行之间的Jaccard相似度?

时间:2018-10-22 05:54:37

标签: python apache-spark for-loop pyspark pairwise

我有一张约有5万行不同行和2列的表格。您可以将每一行视为一部电影,而将各列视为该电影的属性-“ ID”:该电影的ID,“标记”:该电影的某些内容标记,以字符串列表的形式每部电影

数据看起来像这样:

movie_1,[“浪漫”,“喜剧”,“英语”]; movie_2,['action','kongfu','Chinese']

我的目标是首先根据相应的标签计算每部电影之间的提花相似度,完成后,我将能够为每部电影(例如我选择movie_1)知道其他的前5首与这部电影最相似的电影(在本例中为movie_1)。而且,我不仅要让movie_1本身获得前5名的结果,还要使所有电影中都获得前5名的结果。

我尝试使用Python解决问题,但是运行时在这里是一个很大的挑战。即使我使用在6个内核上运行的多处理程序,总运行时间仍持续超过20小时。

下面的Python代码:

import pandas as pd
from collections import Counter
import numpy as np
from multiprocessing import Pool
import time

col_names=['movie_id','tag_name']
df=pd.read_csv("movies.csv",names=col_names)
movie_ids=df['movie_id'].tolist()
tag_list=df['tag_name'].tolist()

def jaccard_similarity(string1, string2):
    intersection = set(string1).intersection(set(string2))
    union = set(string1).union(set(string2))
    return len(intersection)/float(len(union))

def jc_results(movie_id):
    result=Counter()
    this_index=movie_ids.index(movie_id)
    for another_id in movie_ids:
        that_index=movie_ids.index(another_id)
        if another_id==movie_id:
            continue
        else:
            tag_1=tag_list[this_index]
            tag_2=tag_list[that_index]
            jaccard = jaccard_similarity(tag_1,tag_2)
            result[(movie_id,another_id)]=jaccard
    return result.most_common(10)


from multiprocessing import Pool
pool=Pool(6)
results={}
for movie_id in movie_ids:
    results[movie_id]=pool.apply_async(jc_results,args=(movie_id,))
pool.close()
pool.join()
for movie_id, res in results.items():
    results[movie_id] = res.get()

然后我想切换到Pyspark,但是我还是很新手,开始使用python,并在写了几行之后陷入了困境,实际上我唯一取得的进步就是使用sc.textFile将数据读取到RDD中...已经阅读了现有的文章,但他们都在使用Scala。如果有人可以在Pyspark上提供帮助或提供任何指导,那将是很棒的。非常感谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您可以尝试类似于this stackoverflow answer的解决方案,尽管由于您的数据已被标记化(字符串列表),所以您无需执行该步骤或ngram步骤。

我还要提到pyspark中的roximateSimilarityJoin会计算“杰卡德距离”而不是“杰卡德相似度”,但是如果您特别需要,您可以从1中减去以转换回相似度。

您的代码最终看起来类似于:

from pyspark.ml import Pipeline
from pyspark.ml.feature import HashingTF, MinHashLSH
import pyspark.sql.functions as f

db = spark.createDataFrame([
        ('movie_1', ['romantic','comedy','English']),
        ('movie_2', ['action','kongfu','Chinese']),
        ('movie_3', ['romantic', 'action'])
    ], ['movie_id', 'genres'])


model = Pipeline(stages=[
        HashingTF(inputCol="genres", outputCol="vectors"),
        MinHashLSH(inputCol="vectors", outputCol="lsh", numHashTables=10)
    ]).fit(db)

db_hashed = model.transform(db)

db_matches = model.stages[-1].approxSimilarityJoin(db_hashed, db_hashed, 0.9)

#show all matches (including duplicates)
db_matches.select(f.col('datasetA.movie_id').alias('movie_id_A'),
                 f.col('datasetB.movie_id').alias('movie_id_B'),
                 f.col('distCol')).show()

#show non-duplicate matches
db_matches.select(f.col('datasetA.movie_id').alias('movie_id_A'),
                 f.col('datasetB.movie_id').alias('movie_id_B'),
                 f.col('distCol')).filter('movie_id_A < movie_id_B').show()

具有相应的输出:

+----------+----------+-------+
|movie_id_A|movie_id_B|distCol|
+----------+----------+-------+
|   movie_3|   movie_3|    0.0|
|   movie_1|   movie_3|   0.75|
|   movie_2|   movie_3|   0.75|
|   movie_1|   movie_1|    0.0|
|   movie_2|   movie_2|    0.0|
|   movie_3|   movie_2|   0.75|
|   movie_3|   movie_1|   0.75|
+----------+----------+-------+

+----------+----------+-------+
|movie_id_A|movie_id_B|distCol|
+----------+----------+-------+
|   movie_1|   movie_3|   0.75|
|   movie_2|   movie_3|   0.75|
+----------+----------+-------+