具有行和列预测器的R-线性模型

时间:2018-10-16 12:46:38

标签: r glm

对创建模型不熟悉。我有一个矩阵(bpt2t),基因作为行(〜2000),样本(〜400)作为列。矩阵可以是0(表示完整的基因)或1(表示缺失的基因)。

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我尝试使用glm创建一个nullmodel。假设较长的基因比较小的基因具有更多的断裂,并且某些样本具有比其他基因更多的断裂。我遍历此矩阵中的每个项目并将其命名为“ break”。我还有另一个变量“ genelength”,即每个基因的长度。

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因此它使用基因长度来预测断裂:

nullmodel <- glm( break ~ genelength, family = "binomial" )

是否有一种方法还可以包括每个样本的断裂数?我有一个变量,它是每个样本的断裂数,但是它的长度不同于基因长度。

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