我有一些用Rcpp和RcppArmadillo编写的函数,像这样
example.cpp:
#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
#include <iostream>
#include <math.h>
using namespace Rcpp;
// using namespace RcppArmadillo;
using namespace arma;
using namespace std;
// [[Rcpp::export]]
double inner1(NumericVector x, NumericVector y) {
int K = x.length() ;
double ip = 0 ;
for (int k = 0 ; k < K ; k++) {
ip += x(k) * y(k) ;
}
return(ip) ;
}
// [[Rcpp::export]]
mat multiply2(mat A, mat B) {
return A * B;
}
然后我使用Rcpp::sourceCpp('example.cpp')
,它在Ubuntu下运行良好。
(我之前运行过library(Rcpp)
和library(RcppArmadillo)
)
但是,当我移至Windows平台时,RStudio会抛出一个错误消息:
> Rcpp::sourceCpp('R:/example.cpp')
Error in inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...) :
unable to load shared object 'C:/Users/[Username]/AppData/Local/Temp/RtmpG6H80X/sourceCpp-x86_64-w64-mingw32-0.12.19/sourcecpp_40b04b2c2bcf/sourceCpp_4.dll':
LoadLibrary failure: The specified procedure could not be found.
我发现关键问题在于矩阵乘法。由于我尝试删除第二个功能multiply2
。然后可以在Windows下成功编译其余代码。
example2.cpp
#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
#include <iostream>
#include <math.h>
using namespace Rcpp;
// using namespace RcppArmadillo;
using namespace arma;
using namespace std;
// [[Rcpp::export]]
double inner1(NumericVector x, NumericVector y) {
int K = x.length() ;
double ip = 0 ;
for (int k = 0 ; k < K ; k++) {
ip += x(k) * y(k) ;
}
return(ip) ;
}
我尝试了其他一些代码,发现在代码中使用矩阵乘法*
时会发生此错误。
那么,为什么Windows平台下RcppArmadillo中的矩阵乘法失败?
答案 0 :(得分:2)
与编译器苦苦挣扎了很长时间之后,我发现关键是BLAS
库没有在Windows系统环境路径中正确设置。
简而言之,解决方案是:
OpenBLAS-v0.2.19-Win64-int32.zip
到C:\LIBS\OpenBLAS-v0.2.15-Win64-int32
之类的地方C:\LIBS\OpenBLAS-v0.2.15-Win64-int32\bin
添加到您的PATH
BLAS_LIBS
的新环境变量,其值为C:\LIBS\OpenBLAS-v0.2.15-Win64-int32\bin
我通过RcppArmadillo
从源代码安装install.packages("RcppArmadillo", type = "source")
找到了该解决方案,这次RStudio在编译期间抛出了相同的错误,因此安装失败。
但是,如果我只使用install.packages("RcppArmadillo")
,则RStudio将安装RcppArmadillo
的二进制版本,因此我没有收到关于缺少BLAS
的反馈。