从交互式matplotlib图中获取数据

时间:2018-09-28 18:34:23

标签: python matplotlib

我正在尝试将交互式绘图与matplotlib结合使用,以手动更正自动生成的散点图数据。 (该程序尝试检测时间序列数据中的峰值并在每个峰值上放置一个点,但是时间序列数据中存在一些不适当检测到峰值的伪像。)

我已经成功编写了绘制时间序列并覆盖散点图数据的代码,然后用户可以通过单击来添加或删除点。但是,我希望脚本将已编辑的点系列另存为新数组并将其传递给其他函数等。如果没有mouseclick事件,我将无法真正调用该函数,因此我不知道如何返回数据。 / p>

代码从此处改编:Interactively add and remove scatter points in matplotlib

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

fig, ax = plt.subplots(figsize=(16,4))
a_input = np.sin(range(100))*np.random.normal(20,10,100)
b_input = [ 5, 15, 25, 30, 40, 50, 75, 85]

a = plt.plot(range(len(a_input)),a_input,color='red')[0]
b = plt.scatter(b_input,a_input[b_input],color='grey',s=50,picker=5)
newpeaks = np.array([])

def add_or_remove_point(event):
    global a
    xydata_a = np.stack(a.get_data(),axis=1)
    xdata_a = a.get_xdata()
    ydata_a = a.get_ydata()
    global b
    xydata_b = b.get_offsets()
    xdata_b = b.get_offsets()[:,0]
    ydata_b = b.get_offsets()[:,1]
    global newpeaks

    #click x-value
    xdata_click = event.xdata
    #index of nearest x-value in a
    xdata_nearest_index_a = (np.abs(xdata_a-xdata_click)).argmin()
    #new scatter point x-value
    new_xdata_point_b = xdata_a[xdata_nearest_index_a]
    #new scatter point [x-value, y-value]
    new_xydata_point_b = xydata_a[new_xdata_point_b,:]

    if event.button == 1:
        if new_xdata_point_b not in xdata_b:

            #insert new scatter point into b
            new_xydata_b = np.insert(xydata_b,0,new_xydata_point_b,axis=0)
            #sort b based on x-axis values
            new_xydata_b = new_xydata_b[np.argsort(new_xydata_b[:,0])]
            #update b
            b.set_offsets(new_xydata_b)
            newpeaks = b.get_offsets()[:,0]
            plt.draw()
    elif event.button == 3:
        if new_xdata_point_b in xdata_b:
            #remove xdata point b
            new_xydata_b = np.delete(xydata_b,np.where(xdata_b==new_xdata_point_b),axis=0)
            #print(new_xdata_point_b)
            #update b
            b.set_offsets(new_xydata_b)
            newpeaks = b.get_offsets()[:,0]
        plt.draw()

    print(len(newpeaks))
    return newpeaks

fig.canvas.mpl_connect('button_press_event',add_or_remove_point)
plt.show()

有趣的是,b.get_offsets() 仍在函数外部进行更新,因此,如果脚本完成后我在命令行中手动重新分配了newpeaks,我将获得正确的更新数据。但是如果我安排任务

newpeaks = b.get_offsets()[:,0]

在脚本中的函数之后,它将首先运行,并且在绘图关闭时不会更新。我希望它在绘图关闭后立即自动更新,或者以某种方式更新全局变量,而不必手动进行。欢迎任何建议!

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