Question

我已经在python中编写了很多代码，但效果很好。但是现在我正在扩大我正在分析的问题的大小，并且python非常慢。 python代码的缓慢部分是

    for i in range(0,H,1):
       x1 = i - length
       x2 = i + length
       for j in range(0,W,1):
          #print i, ',', j    # check the limits
          y1 = j - length
          y2 = j + length
          IntRed[i,j] = np.mean(RawRed[x1:x2,y1:y2])

当H和W等于1024时，该功能大约需要5分钟才能执行。我编写了一个简单的c ++程序/函数，它执行相同的计算，并且在不到一秒的时间内以相同的数据大小进行操作。

   double summ = 0;
   double total_num = 0;
   double tmp_num = 0 ;
   int avesize = 2;
   for( i = 0+avesize; i <X-avesize ;i++)
     for(j = 0+avesize;j<Y-avesize;j++)
       {
         // loop through sub region of the matrix
         // if the value is not zero add it to the sum
         // and increment the counter. 
         for( int ii = -2; ii < 2; ii ++)
           {
             int iii = i + ii;
             for( int jj = -2; jj < 2 ; jj ++ )
               {
                 int jjj = j + jj; 
                 tmp_num = gsl_matrix_get(m,iii,jjj); 
                 if(tmp_num != 0 )
                   {
                     summ = summ + tmp_num;
                     total_num++;
                   }


               }
           }
         gsl_matrix_set(Matrix_mean,i,j,summ/total_num);
         summ = 0;
         total_num = 0;

       }

我还有其他一些方法可以在2D数组上执行。列出的是一个简单的例子。

我想要做的是将python 2D数组传递给我的c ++函数，并将2D数组返回给python。

我已经阅读了一些关于swig的内容，并且已经解决了过去的问题，看起来它似乎是一种可能的解决方案。但我似乎无法弄清楚我真正需要做什么。

我能得到任何帮助吗？感谢

Answer 1

您可以按照此处所述使用数组：Doc - 5.4.5 Arrays，SWIG库中的carray.i或std_vector.i。我发现使用SWIG库std_vector.i中的std :: vector更容易将python列表发送到C ++ SWIG扩展。虽然在您的情况下优化很重要，但它可能不是最佳的。

在您的情况下，您可以定义：

<强> test.i

%module test
%{
#include "test.h"
%}

%include "std_vector.i"

namespace std {
%template(Line)  vector < int >;
    %template(Array) vector < vector < int> >;
}   

void print_array(std::vector< std::vector < int > > myarray);

<强> test.h

#ifndef TEST_H__
#define TEST_H__

#include <stdio.h>
#include <vector>

void print_array(std::vector< std::vector < int > > myarray);

#endif /* TEST_H__ */

<强> TEST.CPP

#include "test.h"

void print_array(std::vector< std::vector < int > > myarray)
{
    for (int i=0; i<2; i++)
        for (int j=0; j<2; j++)
            printf("[%d][%d] = [%d]\n", i, j, myarray[i][j]);
}

如果运行以下python代码（我使用的是python 2.6.5），您可以看到C ++函数可以访问python列表：

>>> import test
>>> a = test.Array()
>>> a = [[0, 1], [2, 3]]
>>> test.print_array(a)
[0][0] = [0]
[0][1] = [1]
[1][0] = [2]
[1][1] = [3]

使用SWIG将Python数组传递给c ++函数

1 个答案: