KEGG注释

Question

我有一组基因（氨基酸序列）。我想找到基于Kegg的功能注释或KO ID。是否有KEGG数据库可供下载？我想对数据库使用blast。此外，我一直在寻找可以在这方面提供帮助的R包。

希望如此，我已经澄清了我的查询。感谢您的提前答复。

Answer 1

KEGG数据库需要订阅：

https://www.bioinformatics.jp/en/keggftp.html

价格表：

https://www.bioinformatics.jp/docs/subscription_schedule.pdf

如果您仍然感兴趣，这里是可用数据清单：

https://www.kegg.jp/kegg/download/

FASTA序列在这里：

https://www.kegg.jp/kegg/download/Readme/README.fasta