Question

我有一个2D numpy数组，我将其转换为R matrix，现在需要将其进一步转换为named list：

rpy2.robjects.numpy2ri.activate()
nr,nc = counts.shape
r_mtx = robjects.r.matrix(counts, nrow=nr, ncol=nc)

因此，我得到了矩阵r_mtx，但是我不确定如何像从R中那样制作出一个命名列表：

 named_list <- list(counts=mtx)

我需要它输入SingleCellExperiment对象中以进行数据集标准化：

我尝试同时使用rpy2.rlike.container和TaggedList的{{1}}，但不知道如何将它们应用于我的案件。

Answer 1

最终我解决了这个问题（避免将numpy数组转换为r矩阵），直接从numpy数组中生成命名列表：

named_list = robjects.r.list(counts=counts)

counts是2D numpy数组的地方