将numpy数组转换为Matrix rpy2，Kmeans

Question

我有一个numpy 2D数组self.sub 我想在rpy2 kmeans中使用它。 k = robjects.r.kmeans（self.sub，2,20） 我总是得到以下错误： valueError：此刻无法为该类型做任何事情！ 我该怎么办？

Answer 1

从rpy2 docs，R矩阵只是具有dim属性集的向量。所以对于一个numpy二维数组x

import rpy2.robjects as robj

nr, nc = x.shape
xvec = robj.FloatVector(x.transpose().reshape((x.size))
xr = robj.r.matrix(xvec, nrow=nr, ncol=nc)

你必须转换numpy数组，因为R按列填充矩阵。

编辑：实际上，你可以在R矩阵函数中设置byrow = True，然后你就不需要转置。