将提升犬canFam3导入人类hg19

时间:2018-09-10 21:00:38

标签: bioinformatics

嗨,我的问题相对简单。我已经使用UCSC LiftOver将狗坐标转换为人类。这些是200bp的基因间区域,从正常犬到癌犬的甲基化程度不同。

我将它们转换为人体坐标,发现它们中的许多与我们在人体模型中发现的甲基化差异区域重叠。这样可以吗?

我应该检查或修改哪些严格度,需要重叠的最小碱基比率?

最后,这个程序是否采用200bp的狗序列并说至少10%的序列必须与人类基因组中的区域对齐?

我还没有在网上看到足够的答案。

0 个答案:

没有答案