有没有办法对通过rpy2导入的R模块进行腌制/序列化？ （蟒蛇）

Question

我正在开发一个依赖于通过R安装的特定程序的程序包。我宁愿简化安装过程，也不要让用户使用所有程序包为R创建后端。这可能是完全不可避免的，但我想知道是否有任何可能的方法可以通过pickle或Python中的任何序列化模块以序列化形式提供R对象？ 我先尝试泡菜，然后尝试莳萝，但没有运气。 >>>进口泡菜 >>>来自rpy2.robjects.packages导入导入器 >>> r_package = importr（“ dynamicTreeCut”） >>> r_package rpy2.robjects.packages.Package作为<模块'dynamicTreeCut'> >>>使用open（“ ../ dynamicTreeCut.rpy2.pkl”，“ wb”）作为f： ... pickle.dump（r_package，f） ... 追溯（最近一次通话）：   <模块>中第2行的文件“ ” TypeError：无法腌制InstalledSTPackage对象

Answer 1

您需要R才能使用rpy2，如果要使用R软件包，则必须将它们与R一起安装。如何打包R和软件包是一个与rpy2相对独立的问题，并且详细介绍了可能超出Rpy2范围的选项。 SO的答案：docker映像（请参阅rpy2自己的映像with Jupyterlab或jupyterlab and spark），用于预编译二进制文件，.deb或.rpm软件包的专用安装程序，等等。