是否可以使用h5copy复制整个hdf5文件并扩展外部链接?

时间:2018-08-14 06:22:19

标签: hdf5

我有一个带有外部链接的HDF5文件,想将文件复制到一个文件中,这样就不再有外部链接。

是否可以使用h5copy做到这一点?

我尝试过

h5copy --source "/" --destination "/" --flag ext \
       --input celldemo.ims --output output/celldemo_copied.ims

但是我得到了错误:

HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.8.17) thread 140735996208000:
  #000: H5Ocopy.c line 248 in H5Ocopy(): destination object already exists
    major: Symbol table
    minor: Object already exists
Error in copy...Exiting

文件详细信息:

File: celldemo.ims
Groups:
  DataSet
  DataSetInfo
  Thumbnail

组的属性(如HDFView工具中所示):

DataSet
  Link To Target: subfolder/dataset.ims://DataSet
  Type: HDF5 Group
(same for DataSetInfo and Thumbnail)

为什么会出现此错误? “ /”是无效的源对象名称和目标对象名称吗?

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