我对如何安装rdkit和deepchem感到困惑。在这里,我列出了我遇到的问题,感谢您的帮助。
rdkit: 经过几次试验,我终于确定rdkit仅在python2上可用。按照他们网站上的建议,我安装了rdkit:
$ conda create -n rdkit -c rmg rdkit
$ source activate rdkit
我确保从终端窗口调用时获得正确版本的rdkit:
>>> rdkit.__version__
'2016.03.4'
但是,当我打开jupyet笔记本并导入rdkit时,出现错误:
ImportError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-6b72bd8913ab> in <module>()
----> 1 import rdkit
ImportError: No module named rdkit
deepchem: 然后,我继续并安装了deepchem,但是由于对rdkit的依赖性,我无法安装deep chem。
答案 0 :(得分:0)
以下是一些建议:
conda install -c deepchem -c rdkit -c conda-forge -c omnia deepchem=2.3.0
。这将自动为您在同一个环境中安装rdkit。