Question

Linux newbe;

我有一个包含100多个目录的目录，每个目录都有一个内容相似的文件。

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 Final Restraint Analysis for coords: md.rst


 Restraints, deviations, and energy contributions:    pencut =   -0.00

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     First atom        Last atom    curr. value target deviation  penalty
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 *H43  BOC    1 --  H    ALA    2:    4.506    4.760    0.000    0.000 d    0: 0

在这些文件中，有以下几行，如最后一行。我需要在每行中搜索阈值的列罚值，如果大于该行，则应打印到stdout或文件中。我从使用cut开始，但在定界符方面遇到了麻烦，即使我会剪切正确的行文，我也不知道如何保存行号并将此行打印到文件或stdout。

感谢您的帮助

Answer 1

在很多帮助下，我终于有了解决方案：

#! /bin/bash
cutoff=5.0
for i in sim_results_rep*; do

while read -r LINE; do
echo $LINE | grep 'First atom' > /dev/null
if [ $? -ne 0 ]
then
  continue 
else
 read -r LINE 
    while true; do 
      read -r LINE
      echo $LINE | grep 'Total distance penalty' > /dev/null
      if [ $? -ne 0 ] 
      then
       x=`echo "$LINE" | awk '{print $11}'` 
    if [ `echo "$x > $cutoff" | bc` == 1 ] 
    then
      echo "In file $i, the follwing distance has a penalty higher than $cutoff"
      echo $LINE
    else
      continue 

    fi

  else 
    break
    fi

  done
  break 
fi

done < $i/*.nmrout

done

bash脚本；在表格中逐行搜索文件以获取阈值，然后打印到文件或标准输出中

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