在单个图形中覆盖两个ggplot2对象

时间:2018-07-23 09:05:05

标签: r ggplot2 plot

我以前曾尝试寻求帮助,但实际上并没有解决我的问题。 可以在此处找到更多信息:(您可以在此处找到数据集)Survival analysis combining survfit and ggplot objects

不幸的是,由于我的代码主要基于外部程序,因此我无法提供可靠的示例来发布。我很肯定,尽管我的问题可以得到解答。

到达一个点,我创建了2个ggplot2对象,这些对象需要组合成一个图形,一个图形叠加在另一个图形之上。

即,一公里等级的地块:

> class(km.plot$plot)   
[1] "gg"     "ggplot"

和两个:

> class(surv.plot)   
[1] "gg"     "ggplot"

两者共享相同的属性

km.plot $ plot https://i.stack.imgur.com/n5qmm.png

surv.plot https://i.stack.imgur.com/jCUOR.png

我的问题是如何将结果图合并成一个图?也就是说,要使surv.plot和km.plot $ plot彼此重叠。

按照另一个用户的建议执行以下操作会导致错误:

 km.plot$plot + surv.plot$layers[[1]]
 Error in FUN(X[[i]], ...) : object 'label' not found

我认为此错误与以下几行有关

 > surv.plot$layers
 [[1]]
 mapping: y = ~mean, group = ~label, colour = ~label 
 geom_line: na.rm = FALSE
 stat_identity: na.rm = FALSE
 position_identity 

 ggplot(data, aes(x=t)) +
 geom_line(aes(y= mean, group= label, colour= label), size=1.5) +

但是我还添加了Inherit.aes = FALSE,但没有解决我的问题。

我还检查了

> head(surv.plot)
$`data`
curve           t      mean        lci       uci label
1    weibull  0.00000000 1.0000000 1.00000000 1.0000000  Cabo
2    weibull  0.05514645 0.9995771 0.99816278 0.9999721  Cabo
3    weibull  0.11029289 0.9990793 0.99646259 0.9999098  Cabo
4    weibull  0.16543934 0.9985407 0.99479769 0.9998211  Cabo
5    weibull  0.22058579 0.9979715 0.99316001 0.9997176  Cabo



 > head(km.plot)
 $`plot`

 $`data.survplot`
 time n.risk n.event n.censor      surv    std.err     upper     lower
 1   0.4271047     79       0        1 1.0000000 0.00000000 1.0000000 1.0000000
 2   1.0841889     78       1        0 0.9871795 0.01290349 1.0000000 0.9625264
 3   1.3470226     77       1        0 0.9743590 0.01836796 1.0000000 0.9399054
 4   3.9753593     76       1        0 0.9615385 0.02264554 1.0000000 0.9197944
 5   4.0082136     75       1        0 0.9487179 0.02632491 0.9989527 0.9010094

我感到困惑。我几乎可以肯定这是可以做到的,因为两个对象在结构上基本上是相同的,所以我看不出为什么不能做到这一点。但是我花了很多时间没有希望。我真的希望有人能指导我!

感谢您抽出宝贵时间阅读这篇文章

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