Python / Scipy 2D插值(非均匀数据)

时间:2011-02-28 18:30:31

标签: python numpy scipy interpolation

这是我之前发布的帖子的后续问题:Python/Scipy Interpolation (map_coordinates)

假设我想插入2d矩形区域。我的变量'z'包含如下所示的数据。每列都是一个常量值,但是,数组的每一行可能处于不同的值,如下面的注释所示。

from scipy import interpolate
from numpy import array
import numpy as np
#                                               # 0.0000, 0.1750, 0.8170, 1.0000
z = array([[-2.2818,-2.2818,-0.9309,-0.9309],   # 0.0000, 0.0000, 0.0000, 0.0000
           [-2.2818,-2.2818,-0.9309,-0.9309],   # 0.2620, 0.2784, 0.3379, 0.3526
           [-1.4891,-1.4891,-0.5531,-0.5531],   # 0.6121, 0.6351, 0.7118, 0.7309
           [-1.4891,-1.4891,-0.5531,-0.5531]])  # 1.0000, 1.0000, 1.0000, 1.0000
# Rows, Columns = z.shape

cols = array([0.0000, 0.1750, 0.8170, 1.0000])
rows = array([0.0000, 0.2620, 0.6121, 1.0000])

sp = interpolate.RectBivariateSpline(rows, cols, z, kx=1, ky=1, s=0)

xi = np.array([0.00000, 0.26200, 0.27840, 0.33790, 0.35260, 0.61210, 0.63510,
               0.71180, 0.73090, 1.00000], dtype=np.float)
yi = np.array([0.000, 0.167, 0.815, 1.000], dtype=np.float)
print sp(xi, yi)

作为另一种可视化方法,我知道的值数组将是:

rows = array([0.0000, 0.2620, 0.2784, 0.3379, 0.3526,
                      0.6121, 0.6351, 0.7118, 0.7309, 1.0000])
#          # 0.0000, 0.1750, 0.8170, 1.0000
z = array([[-2.2818,-2.2818,-0.9309,-0.9309],   # 0.0000
           [-2.2818,      ?,      ?,      ?],   # 0.2620,
           [      ?,-2.2818,      ?,      ?],   # 0.2784
           [      ?,      ?,-0.9309,      ?],   # 0.3379
           [      ?      ,?,      ?,-0.9309],   # 0.3526
           [-1.4891,      ?,      ?,      ?],   # 0.6121
           [      ?,-1.4891,      ?,      ?],   # 0.6351
           [      ?,      ?,-0.5531,      ?],   # 0.7118
           [      ?,      ?,      ?,-0.5531],   # 0.7309
           [-1.4891,-1.4891,-0.5531,-0.5531]])  # 1.0000

我不知道'?'值,它们应该插值。我尝试用None替换它们,但是对于我的所有结果都得到'nan'。

修改

我想我需要使用'griddata'或'interp2'。 griddata似乎产生了我期望的结果,但'interp2'却没有。

from scipy import interpolate
from numpy import array
import numpy as np

z = array([[-2.2818,-2.2818,-0.9309,-0.9309],
           [-2.2818,-2.2818,-0.9309,-0.9309],
           [-1.4891,-1.4891,-0.5531,-0.5531],
           [-1.4891,-1.4891,-0.5531,-0.5531]])

rows = array([0.0000, 0.0000, 0.0000, 0.0000,
              0.2620, 0.2784, 0.3379, 0.3526,
              0.6121, 0.6351, 0.7118, 0.7309,
              1.0000, 1.0000, 1.0000, 1.0000])

cols = array([0.0000, 0.1750, 0.8180, 1.0000,
              0.0000, 0.1750, 0.8180, 1.0000,
              0.0000, 0.1750, 0.8180, 1.0000,
              0.0000, 0.1750, 0.8180, 1.0000])

xi = array([0.0000, 0.2620, 0.2784, 0.3379, 0.3526, 0.6121, 0.6351, 0.7118,
               0.7309, 1.0000], dtype=np.float)
yi = array([0.000, 0.175, 0.818, 1.000], dtype=np.float)

GD = interpolate.griddata((rows, cols), z.ravel(),
                          (xi[None,:], yi[:,None]), method='linear')
I2 = interpolate.interp2d(rows, cols, z, kind='linear')

print GD.reshape(4, 10).T
print '\n'
print I2(xi, yi).reshape(4, 10).T

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy.ma as ma

plt.figure()
GD = interpolate.griddata((rows.ravel(), cols.ravel()), z.ravel(),
                          (xi[None,:], yi[:,None]), method='linear')
CS = plt.contour(xi,yi,GD,15,linewidths=0.5,colors='k')
CS = plt.contourf(xi,yi,GD,15,cmap=plt.cm.jet)
plt.colorbar()
plt.scatter(rows,cols,marker='o',c='b',s=5)

plt.figure()
I2 = I2(xi, yi)
CS = plt.contour(xi,yi,I2,15,linewidths=0.5,colors='k')
CS = plt.contourf(xi,yi,I2,15,cmap=plt.cm.jet)
plt.colorbar()
plt.scatter(rows,cols,marker='o',c='b',s=5)
plt.show()

1 个答案:

答案 0 :(得分:16)

看起来你明白了。

在您的上方代码示例和之前的linked)问题中,您有结构化数据。哪个可以使用RectBivariateSplineinterp2d进行插值。这意味着您可以在网格上描述数据(网格上的所有点都具有已知值)。网格不一定必须具有相同的dx和dy。 (如果所有dx和dy都相等,那么你就有了一个规则网格)

现在,您当前的问题询问如果不知道所有要点该怎么做。这称为非结构化数据。你所拥有的只是一个领域的精选点。您不一定要构造所有顶点都具有已知值的矩形。对于此类数据,您可以使用(如您所有)griddataBivariateSpline的风格。

现在选哪个?

与结构化RectBivariateSpline最接近的类比是非结构化 BivariateSpline classesSmoothBivariateSplineLSQBivariateSpline之一。如果要使用样条线来插入数据,请使用这些。这使得您的功能平滑且可微分,但您可以获得一个在Z.max()或Z.min()之外摆动的曲面。

由于您正在设置ky=1kx=1并且正在获得我非常确定的结构化数据的线性插值,我个人只是从RectBivariateSpline 结构化网格插值方案的__doc__样条线方案。我知道文档说它适用于interp2d,但{{1}}本身的示例只是结构化,而非常规。

如果您在最终切换时发现方法之间存在任何显着差异,我会很好奇。欢迎来到SciPy。