在summary.rms中使用自动变量名称

时间:2018-07-15 19:12:28

标签: r

我想为多个不同的暴露变量建立回归模型,并使用rms函数Predictsummary.rms显示结果(以显示20和80百分位数之间的差异) rms包中的

library(rms)

# for datadist, ols, summary and predict

exp.var <- names(iris[,c(2:3)])

ddist <- datadist(iris); options(datadist="ddist")

for (exp in exp.var) {
   mod <- ols(formula(paste("Sepal.Length ~ Petal.Width + ", exp, sep="")), data=iris)
   #p.mod <- Predict(mod, name=exp)
   summary(mod, exp=quantile(iris[,exp], probs=c(0.2, 0.8)))
}

Predict的第一个问题已在previous question中得到解决,但是summary.rms仍然会导致错误消息:

Error in summary.rms(mod, exp = quantile(iris[, exp], probs = c(0.2, 0.8))): 
 factor name(s) not in the design: exp

当我替换变量(例如exp="Petal.Length")时,它没有问题:

summary(mod, Petal.Length=quantile(iris[,exp], probs=c(0.2, 0.8)))

是否可以将exp作为变量传递给summary.rms

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