如何在R中绘制成对的采样距离(Bray-Curtis)的箱线图?

时间:2018-07-05 03:06:10

标签: r boxplot

我在R中有一个数据帧,它是频率的稀疏矩阵。数据框的示例如下:

enter image description here

我可以在矩阵的数值部分上计算出bray-curtis相异性,这给了我像样对的值,如下所示: enter image description here

即使它显示如上所示的矩阵,它实际上也像一维数组一样存储。现在,我想找出一种方法来对嵌套的巢穴即A-B,A-C,B-C距离和巢内距离A,B,C进行箱形绘图。 一些达到此目的的指针将是很棒的。 通过使用R中的“素食主义者”包的vegdist()函数,我发现了bray-curtis差异索引。

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