在igraph中绘制网络图或在R中使用其他程序包绘制图，每个节点都依赖于协变量？

Question

我目前有一个R语言的网络，该网络具有邻接矩阵，边列表和网络格式，我想根据每个节点的协变量进行绘制。我有三个协变量age，class和score，其中age为0或1，class的范围为1至50，而{{1 }}的范围是0到100。我想知道R中的哪个包可能有助于绘制节点及其网络边缘，其节点颜色取决于score，节点的符号取决于class，以及一个依赖于age的节点？ score中是否存在此类方法？谢谢！

Answer 1

以下是使用igraph的示例。由于您不提供任何数据，因此我将举例说明一些随机生成的数据。

library(igraph)

set.seed(12)
g = erdos.renyi.game(10,0.33)

V(g)$age   = sample(0:1, 10, replace=TRUE)
V(g)$class = sample(50, 10,   replace=TRUE)
V(g)$score = sample(0:100, 10, replace=TRUE)

plot(g, vertex.shape = c("circle", "square")[V(g)$age + 1],
    vertex.color = rainbow(50)[V(g)$class],
    vertex.size = round(sqrt(V(g)$score+25)),
    vertex.label.dist = 1.5)

评论

1. 我怀疑一个人可以区分50种颜色以从图形中读取50个类的值。

2. 您希望节点的大小取决于分数，分数从0到100。您当然不希望任何大小为零的节点，并且您当然不希望任何节点的大小是另一个节点的100倍。节点。因此，我使用size = round(sqrt(V(g)$score+25))来避免这些问题。

3. 因为当节点非常小时很难读取标签，所以我用vertex.label.dist = 1.5

将标签稍微移到了侧面