图复用网络

Question

我想知道绘制多重网络图的最佳软件。我试图在Gephi中做我想做的事，但它无法满足我的需求。我知道如何使用R或Matlab，因此首选使用此软件的工具。

基本上，我想将互惠形象化。例如，假设我们有四个人两个时期。在第一阶段，每个人都向另一个人送礼物。在第二阶段，每个玩家都会提供新的礼物，并且可以选择从第一阶段中收回礼物。

首先，我想使用某种形式的spring算法绘制一个周期的网络图，该算法将链接的节点拉近并排斥未链接的节点。 Gehpi可以很容易地做到这一点。

Gephi无法做到的是，以不同的颜色并排显示垂直的两个连接。取而代之的是，Gephi将每个连接都放在彼此之间，这样您就看不到往复的礼物。在这一阶段，我将再次使用spring算法，以便使往复的节点靠得更近，并且对未往复的节点进行排斥。这将为我提供汇总的网络可视化信息，以配合我计算的统计信息。

This image might give a good indication of what I want to do

谢谢。

Answer 1

我很高兴你看到Muxviz。学习曲线可能会有些许变化，您需要以所需的方式将数据存储在那里，但是Muxviz可能非常强大。

如果您只想一次性解决快速问题，则可以尝试使用相同的layout在igraph中绘制图层（或者为什么不将Gephi导出为svg / pdf）用手将它们叠加在Illustrator中。