我有一个函数,需要创建一个表(tab
,然后更改一个值-函数调用中给定tab.names() == k
和k
的值。>
看着http://dirk.eddelbuettel.com/code/rcpp/Rcpp-quickref.pdf,我希望下面的代码能用(用变量名代替"foo"
),但是我想这要求元素名是静态的,我的会成功。没错我尝试使用which
,但无法编译(从'char'到'Rcpp :: traits :: storage_type <16> :: type {aka SEXPREC *}的无效转换-所以我正在做那里有问题。
#include <RcppArmadillo.h>
#include <algorithm>
//[[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
IntegerVector fun(const arma::vec& assignment, int k) {
// count number of peptides per protein
IntegerVector tab = table(as<IntegerVector>(wrap(assignment)));
CharacterVector all_proteins = tab.names();
char kc = '0' + k;
// what I need a working version of:
tab(kc) = 1; // gets ignored, as does a [] version of the same thing.
// or
tab('0' + k) = 1; // also ignored
int ki = which(all_proteins == kc); // gives me compile errors
// extra credit
// tab.names(k-1) = "-1";
return tab;
}
/*** R
set.seed(23)
x <- rpois(20, 5)
k <- 5
fun(x, k)
# same thing in R:
expected_output <- table(x)
expected_output # before modification
# x
# 3 4 5 6 7 9 10 12
# 2 4 3 3 4 2 1 1
expected_output[as.character(k)] <- 1 # this is what I need help with
expected_output
# x
# 3 4 5 6 7 9 10 12
# 2 4 1 3 4 2 1 1
# extra credit:
names(expected_output)[as.character(k)] <- -1
*/
我仍在学习rcpp,更重要的是,我仍在学习如何阅读手册页并将正确的搜索字词插入google / stackoverflow。我确信这是基本的知识(并且我乐于接受更好的方法-我目前在问题的初始方法方面像R程序员一样,而不是C ++程序员。)
(顺便说一句-在代码的其他部分中使用了arma::vec
,为了简化起见,我没有展示它-我意识到这里没有用。我曾就切换它进行过辩论,但在我已经测试了该部分的原理,它起作用了,我最后要做的就是引入一个额外的错误...)
谢谢!
答案 0 :(得分:2)
您可以使用.findName()
方法来获取相关的index
:
#include <RcppArmadillo.h>
#include <algorithm>
//[[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
IntegerVector fun(const arma::vec& assignment, int k) {
// count number of peptides per protein
IntegerVector tab = table(as<IntegerVector>(wrap(assignment)));
CharacterVector all_proteins = tab.names();
int index = tab.findName(std::string(1, '0' + k));
tab(index) = 1;
all_proteins(index) = "-1";
tab.names() = all_proteins;
return tab;
}
/*** R
set.seed(23)
x <- rpois(20, 5)
k <- 5
fun(x, k)
*/
输出:
> Rcpp::sourceCpp('table-name.cpp')
> set.seed(23)
> x <- rpois(20, 5)
> k <- 5
> fun(x, k)
3 4 -1 6 7 9 10 12
2 4 1 3 4 2 1 1
答案 1 :(得分:1)
您可以编写自己的函数(使用String
代替char
):
int first_which_equal(const CharacterVector& x, String y) {
int n = x.size();
for (int i = 0; i < n; i++) {
if (x[i] == y) return(i);
}
return -1;
}
此外,似乎tab(kc)
会将kc
转换为整数表示形式。