在R

Question

我对R没有太多的了解。我有一个.txt文件，它带有一个相关矩阵，该矩阵以前是从很长的记录中创建的。

文件中的文本类似于：

"15075060" "15085030" "15085040"
"15075060" 1 0.441716695007761 0.433807683928689
"15085030" 0.441716695007761 1 0.477591938543259
"15085040" 0.433807683928689 0.477591938543259 1

这是一个有代表性的示例，因为实数矩阵要大得多。引号中的数字是相关的来源。 我使用read.table读取数据以创建数据框，然后使用以下命令将其转换为矩阵（称为matto）：

mattox =matrix(as.numeric(unlist(matto)),nrow=nrow(matto))

然后我得到一个像这样的矩阵：

>mattox
          [,1]      [,2]      [,3]
[1,] 1.0000000 0.4417167 0.4338077
[2,] 0.4417167 1.0000000 0.4775919
[3,] 0.4338077 0.4775919 1.0000000

作为选项2，如果我使用以下命令将其转换为矩阵：

as.matrix(sapply(matto, as.numeric))

然后我得到一个像这样的矩阵：

> matto
         X.15075060 X.15085030 X.15085040
15075060  1.0000000  0.4417167  0.4338077
15085030  0.4417167  1.0000000  0.4775919
15085040  0.4338077  0.4775919  1.0000000

尽管我不知道为什么我要在列标题的数字之前得到那些X

当我尝试使用corrplot函数绘制此相关性时，我得到了矩阵矩阵的类似信息：

corrplot(mattox, type="upper")

但是问题是我在这里看不到列和行的标题（.txt文件中带引号的数字）。对于其他矩阵（matto），当我尝试使用Corrplot时出现错误，错误提示：

Error in matrix(if (is.null(value)) logical() else value, nrow = nr, dimnames = list(rn,  : 
  length of 'dimnames' [2] not equal to array extent

我想获得一个图形，就像我获得的图形一样，但是具有列和行的名称，而不是数字1,2,3 ... 类似于下图，我在网上找到了其他情况：

我该如何解决？

Answer 1

您可以跳过这些步骤，而在阅读时将其强制转换为矩阵，并且应该已经是数字了。由于有names being duplicates，因此在名称前加上了x。不过，您可以指定colnames。

df <- as.matrix(read.table("location/of/text.txt", row.names = 1))
colnames(df) <- c("15075060", "15085030", "15085040")

str(df) # check the structure, it's numeric so we're good
num [1:3, 1:3] 1 0.442 0.434 0.442 1 ...
- attr(*, "dimnames")=List of 2
 ..$ : chr [1:3] "15075060" "15085030" "15085040"
 ..$ : chr [1:3] "15075060" "15085030" "15085040"

corrplot(df, type = "upper")