奇异运行并执行命令

Question

我知道如何执行奇点：

singularity run /mn/sarpanitu/singularity/test/fenics-and-more.img

是否有一种方法可以执行一行（或更多）来运行上一条命令，然后以奇异的方式运行echo "hi there"？ （当然，在生产中，我会使用比hi更复杂的东西）。完成此操作后，我希望我的奇点还可以互动使用。

类似这样的意图：

singularity run /mn/sarpanitu/singularity/test/fenics-and-more.img -bash-command echo "hi there"

或

singularity run /mn/sarpanitu/singularity/test/fenics-and-more.img -run-script-at-startup script.sh

Answer 1

使用exec而不是run在容器内执行命令。添加外壳程序和脚本作为参数。

singularity exec /mn/sarpanitu/singularity/test/fenics-and-more.img /bin/sh script.sh

还要在runscript部分中将参数的执行作为默认的运行时命令添加。

%runscript
  exec "$@"

Answer 2

这与以下问题非常相关：bash script to perform action in a singularity container it opens。解决方案在那里发布，基本上使用-c选项并生成bash控制台。