如何使用ALLPATH-LG

时间:2018-06-13 17:02:02

标签: genome

我实际上需要你的帮助,因为这是我第一次组装基因组。

我拥有2个fasta文件:reads1.fq和reads2.fq这些文件来自Illumina Hiseq 3000 150bp,我的物种的基因组大小约为1.5 GB。

我想使用程序ALLPATH-LG这样做。我在发布问题之前阅读了手册,但我仍然不知道该怎么做。我应该首先准备我的数据,还是只有一个命令用我的两个fasta文件执行,程序单独运行?

如果有人能够更详细地向我解释这个过程的详细信息,或者如果有人已经使用过这个程序,如果他可以向我解释这个过程的步骤,那将是非常好的。

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