我试图使用FeatureTools规范化表格以进行特征合成。我的表格类似于Max-Kanter对How to apply Deep Feature Synthesis to a single table的回复。我遇到了一个例外情况,我很感激一些帮助。
异常来自featuretools.entityset.entity.entityset_convert_variable_type
,它似乎无法处理时间类型。
异常的性质是什么,我可以解决它吗?
表格df
:
PatientId | AppointmentID | Gender | ScheduledDay | AppointmentDay | Age | Neighbourhood | Scholarship | Hipertension | Diabetes | Alcoholism | Handcap | SMS_received | No-show
12345 | 5642903 | F | 2016-04-29 | 2016-04-29 | 62 | JARDIM DA | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | No
67890 | 3902943 | M | 2016-03-18 | 2016-04-29 | 44 | Other Nbh | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | Yes
...
我的代码:
appointment_entity_set = ft.EntitySet('appointments')
appointment_entity_set.entity_from_dataframe(
dataframe=df, entity_id='appointments',
index='AppointmentID', time_index='AppointmentDay')
# error generated here
appointment_entity_set.normalize_entity(base_entity_id='appointments',
new_entity_id='patients',
index='PatientId')
ScheduledDay和AppointmentDay的类型为pandas._libs.tslib.Timestamp
,与Max-Kanter's response中的情况类似。
例外:
~/.virtualenvs/trane/lib/python3.6/site-packages/featuretools/entityset/entity.py in entityset_convert_variable_type(self, column_id, new_type, **kwargs)
474 df = self.df
--> 475 if df[column_id].empty:
476 return
477 if new_type == vtypes.Numeric:
Exception: Cannot convert column first_appointments_time to <class 'featuretools.variable_types.variable.DatetimeTimeIndex'>
featuretools == 0.1.21
答案 0 :(得分:3)
出现的错误似乎是pandas正在读取AppointmentDay
变量的方式的问题。我们实际上有一个带有该数据集的示例Kaggle kernel。在那里,我们需要将pandas.read_csv
与parse_dates
:
data = pd.read_csv("data/KaggleV2-May-2016.csv", parse_dates=['AppointmentDay', 'ScheduledDay'])
返回一个pandas系列,其值为numpy.datetime64
。这应该加载到Featuretools中。
另外,您能否确保从pip获得最新版本的Featuretools?该堆栈跟踪中有一个set trace命令,该命令不在最新版本中。