使用FeatureTools时,无法使用时间戳将normalize_entity转换为列

时间:2018-06-12 15:11:17

标签: featuretools

我试图使用FeatureTools规范化表格以进行特征合成。我的表格类似于Max-Kanter对How to apply Deep Feature Synthesis to a single table的回复。我遇到了一个例外情况,我很感激一些帮助。

异常来自featuretools.entityset.entity.entityset_convert_variable_type,它似乎无法处理时间类型。

异常的性质是什么,我可以解决它吗?

表格df

PatientId | AppointmentID | Gender | ScheduledDay | AppointmentDay | Age | Neighbourhood | Scholarship | Hipertension | Diabetes | Alcoholism | Handcap | SMS_received | No-show
12345     | 5642903       | F     | 2016-04-29    | 2016-04-29     | 62  | JARDIM DA     | 0           | 1            | 0        | 0          | 0       | 0            | No
67890     | 3902943       | M     | 2016-03-18    | 2016-04-29     | 44  | Other Nbh     | 1           | 1            | 0        | 0          | 0       | 0            | Yes
...

我的代码:

appointment_entity_set = ft.EntitySet('appointments')
appointment_entity_set.entity_from_dataframe(
    dataframe=df, entity_id='appointments',
    index='AppointmentID', time_index='AppointmentDay')

# error generated here
appointment_entity_set.normalize_entity(base_entity_id='appointments',
    new_entity_id='patients',
    index='PatientId')

ScheduledDay和AppointmentDay的类型为pandas._libs.tslib.Timestamp,与Max-Kanter's response中的情况类似。

例外:

~/.virtualenvs/trane/lib/python3.6/site-packages/featuretools/entityset/entity.py in entityset_convert_variable_type(self, column_id, new_type, **kwargs)
    474         df = self.df
--> 475         if df[column_id].empty:
    476             return
    477         if new_type == vtypes.Numeric:

Exception: Cannot convert column first_appointments_time to <class 'featuretools.variable_types.variable.DatetimeTimeIndex'>

featuretools == 0.1.21

此数据集来自Kaggle Show or No Show competition

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

出现的错误似乎是pandas正在读取AppointmentDay变量的方式的问题。我们实际上有一个带有该数据集的示例Kaggle kernel。在那里,我们需要将pandas.read_csvparse_dates

一起使用
data = pd.read_csv("data/KaggleV2-May-2016.csv", parse_dates=['AppointmentDay', 'ScheduledDay'])

返回一个pandas系列,其值为numpy.datetime64。这应该加载到Featuretools中。

另外,您能否确保从pip获得最新版本的Featuretools?该堆栈跟踪中有一个set trace命令,该命令不在最新版本中。