Question

我正在编写一个Dockerfile，想知道如何正确添加带有预编译的r包的ppa。我的以下代码给出了错误消息：

阅读包裹清单......
  W：存储库＆＃39; http://ppa.launchpad.net/marutter/c2d4u/ubuntu cosmic Release＆＃39;没有发布文件。
  E：无法获取http://ppa.launchpad.net/marutter/c2d4u/ubuntu/dists/cosmic/main/binary-amd64/Packages 404未找到
  E：某些索引文件无法下载。它们被忽略了，或者使用了旧的。

我不明白为什么他找不到它，虽然我可以找到发布文件here。

我的基本图片是postgres，您可以将其拉为

docker pull postgres

我在添加PPA后调用RUN apt-get update时遇到错误：

# Load base image
FROM postgres

RUN apt-get update && \
    apt-get install -y software-properties-common && \
    apt-get install -y apt-transport-https

RUN apt-get update
RUN apt-get install -y wget
# More stuff here
RUN apt-get install -y r-base r-base-dev 

# add cran mirror
RUN apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E084DAB9
RUN echo "deb-src https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/" | tee -a /etc/apt/sources.list

# add PPA with pre-compiled cran packages
RUN add-apt-repository -y ppa:marutter/c2d4u 

# install some R packages
RUN apt-get update
RUN apt-get install -y r-cran-data.table
RUN apt-get install -y r-cran-tidyverse

如果我不打电话RUN apt-get update他找不到tidyverse（但找到data.table）

Answer 1

基本问题是postgres图像基于Debain稳定，而您尝试添加适用于Ubuntu的图像。我看到了三种可能的方法：

尽可能通过postgres图像使用Debian稳定版，并从源代码安装缺少的tidyverse软件包。
通过postgres图像将Debian稳定与R 3.5的CRAN反向端口一起使用，并从源代码编译所有包
使用Ubuntu图片和c2d4u（例如https://hub.docker.com/r/rocker/r-apt/）并在其上添加postgres。

Answer 2

我相信你的Docker文件中有拼写错误。

RUN echo "deb-src https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/" | tee -a /etc/apt/sources.list

应该是

RUN echo "deb-src https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu/xenial/" | tee -a /etc/apt/sources.list

这会解决您的问题吗？

在Dockerfile中为R添加CRAN镜像/ PPA

2 个答案: