Question

我正在尝试通过以下方式通过R提示安装软件包：

install.packages('RMySQL')

但输出如下：

--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---

没有别的！我无法找到解决这个非常基本问题的方法。为了选择CRAN镜像，我应该输入什么？

编辑：

操作系统：Mac-OS X 10.6.8 R版本：2.15.0

Answer 1

您应该获得一个包含存储库列表的窗口或带有一些选项的文本菜单。但是，如果没有出现，您可以始终使用repos参数指定自己下载软件包的镜像。通过这样做，R将不再向您询问有关存储库的信息。例如：

install.packages('RMySQL', repos='http://cran.us.r-project.org')

这里有一个list of mirrors代表R。

Answer 2

这是我的工作，基本上直接来自example(Startup)页面：

## Default repo
local({r <- getOption("repos")
       r["CRAN"] <- "http://cran.r-project.org" 
       options(repos=r)
})

位于~/.Rprofile。

编辑：由于现在是2018年，我们可以补充一点，在过去的几年里，网址"https://cloud.r-project.org"更受欢迎，因为它反映了a）https访问权限和b）“总是 - 你在附近“CDN。

Answer 3

我是粉丝：

chooseCRANmirror()

这将打印输出中的镜像列表（不用担心弹出窗口，因为你从终端运行它），然后输入你想要的数字。

Answer 4

我使用Dirk建议的〜/ .Rprofile解决方案，但我只想指出

chooseCRANmirror(graphics=FALSE)

似乎是明智的做法，而不是

chooseCRANmirror(81)

，这可能有用，但涉及到神奇的数字81（或者这可能是促进旅游业的微妙方式81 =英国（布里斯托尔）:-)）

Answer 5

存储库选择屏幕无法在您的系统（OS X）上显示，因为OS X不再包含X11。 R试图通过X11向您显示提示。从http://xquartz.macosforge.org/landing/安装X11。然后运行install命令。将显示回购选择提示。

Answer 6

如果您需要以非交互方式设置镜像（例如在部署脚本中执行rbundler安装），您可以这样做：

首先手动运行：

chooseCRANmirror()

选择最适合您的镜像编号并记住它。然后自动选择：

R -e 'chooseCRANmirror(graphics=FALSE, ind=87);library(rbundler);bundle()'

其中87是您要使用的镜像号。此代码片段还会为您安装rbundle。如果你愿意，可以省略。

Answer 7

我用过

chooseCRANmirror(81)

它会提示您选择国家/地区。然后，您可以通过键入此处指定的国家/地区镜像代码进行选择。

Answer 8

无论您是在终端中使用R还是使用RStudio等IDE，都会弹出一个下拉菜单供您选择（或者您可以选择一组数字）。 Windows，Mac OS和大多数Linux系统都支持此功能。但是，它可能需要其他配置或依赖项，例如X-windows。

要在使用远程访问时启用X-windows，请使用以下-XY标志：

ssh -XY username@server.domain

通常有一个默认仓库，但如果您遇到任何问题，可以指定，例如运行脚本或Rmarkdown / knitr。每次安装时都可以使用repo opset镜像或存储库进行CRAN：

install.packages("package", repo="<your.nearest.mirror>")

建议您使用离您所在位置最近的镜像，以便更快地下载。例如：

install.packages("RMySQL", repos="https://cran.stat.auckland.ac.nz/")

您还可以在会话中设置repos选项，这样您每个交互式会话（或脚本）只需要一次。您可以检查repos是否配置了：

options(repos)

如果获得"Error in options(repos) : object 'repos' not found"，则可以设置存储库选项。例如：

options(repos = "https://cran.stat.auckland.ac.nz/")

然后它应该像往常一样安装软件包。例如：

install.packages("RMySQL")

正如其他人所提到的，您可以在.Rprofile文件中配置存储库，并使其适用于所有脚本。您是否更喜欢系统中的“全局”选项或会话或脚本中的“本地”选项取决于您。这些“本地”选项需要更多时间才能使用每个会话，但如果他们没有.Rprofile，则可以使其他人能够使用您的脚本。

Answer 9

我在macOS上说过你说的确切的事情：'请选择'提示然后再没有了。

我打开（并更新;不知道是否相关）X-Quartz，然后重新启动R并再次尝试，我得到一个X窗口的镜像列表，可在几秒钟后选择。第三次开始时速度更快。

Answer 10

您也可以通过运行或将其放入Rprofile

来禁用所有图形菜单

options(menu.graphics = FALSE)

Answer 11

加入~/.Rprofile

local({r <- getOption("repos")
    r["CRAN"] <- "mirror_site"  #for example, https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/
    options(repos=r)
    options(BioC_mirror="bioc_mirror_site") #if using biocLite
})

如何在R中选择CRAN镜像

11 个答案: