ggplot2:重叠两层时出错

时间:2018-05-08 09:50:18

标签: r ggplot2 dplyr

以下以简化的方式描述了我经常运行但从未使其工作的问题。它与叠加具有不同信息的图层有关。

感谢任何帮助。

library(dplyr)
library(ggplot2)

df = data.frame(id = c(1,1,1,1,2,2,2,3,3,3), 
            year = c(2000,2001,2002,2003,2000,2001,2002,2001,2002,2003),
            meas = c(1.1,1.2,NA,1.4,2.1,1.9,1.8,3.1,3.0,3.3))

df$id   = as.factor(df$id)
df$year = as.factor(df$year)

tib = as.tbl(df)
产生tibble的

# A tibble: 10 x 3
       id   year  meas
   <fctr> <fctr> <dbl>
 1      1   2000   1.1
 2      1   2001   1.2
 3      1   2002    NA
 4      1   2003   1.4
 5      2   2000   2.1
 6      2   2001   1.9
 7      2   2002   1.8
 8      3   2001   3.1
 9      3   2002   3.0
10      3   2003   3.3

目前,我计算了横截面中每年测量的中位数。

tib2 = tib %>% group_by(year) %>%       
    summarise(medi=median(meas,na.rm=T))
tib2

按预期给出

# A tibble: 4 x 2
    year  medi
  <fctr> <dbl>
1   2000  1.60
2   2001  1.90
3   2002  2.40
4   2003  2.35

到目前为止一切顺利。现在,我创建了我的第一个情节

p = ggplot(tib, aes(x = year, y = meas, group = id, color = id)) p = p + geom_line() p 产生

enter image description here

另一方面,下面会产生一组胖点,因为它应该

p1=ggplot(tib2, aes(x = year, y = medi)) + geom_point(colour = 'red', size = 3)
p1

Red dots

我尝试将红点放在第一个图中,如下所示:

p = p + geom_point(data = tib2, aes(x = year, y = medi), colour = 'red', size = 3)
p

这是我收到错误的地方:

  

不知道如何自动选择类型函数对象的比例。违约持续。   错误(函数(...,row.names = NULL,check.rows = FALSE,check.names = TRUE,   这些论点意味着不同的行数:4,0

备注:我注意到缺失的值会引起红线的切割,我可能希望进行插值。当我将NA替换为某个值时,错误仍然存​​在。

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

你可以尝试

ggplot(tib, aes(x = year, y = meas, group = id, color = id)) +
   geom_line() +
   stat_summary(fun.y = median, geom="point", aes(group=year), colour = 'red', size = 3)

enter image description here

或用作推荐的Dash2

ggplot() +
   geom_line(data=tib, aes(x = year, y = meas, group = id, color = id)) +
   geom_point(data = tib2, aes(x = year, y = medi), colour = 'red', size = 3) 

答案 1 :(得分:2)

“类型函数的对象”错误与dplyr::id()函数有关。

当您在ggplot调用中指定美学时,它适用于所有绘图,并且在第一个geom in the tib dataframe context, the tib2`上下文中正确解释它时没有它,所以它会产生错误。

您可以将相关的aes传递给单geom,也可以在inherit.aes = FALSE geom'上使用tib2

library(ggplot)

ggplot(tib) + 
  geom_line(aes(x = year, y = meas, group = id, color = id)) +
  geom_point(data = tib2, aes(x = year, y = medi), size = 3, color = 'red')


ggplot(tib, aes(x = year, y = meas, group = id, color = id)) + 
  geom_line() +
  geom_point(data = tib2, aes(x = year, y = medi), size = 3, color = 'red', inherit.aes = FALSE)

或者更优雅的是,请指定aes来电中常见的ggplot以及其他需要的地方:

ggplot(tib, aes(x = year)) + 
  geom_line(aes(y = meas, group = id, color = id)) +
  geom_point(data = tib2, aes(y=medi), size = 3, color = 'red')

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