我试图绘制一个时间序列及其相应的9年运行平均值。我正在使用"动物园"中的rollapply功能。封装
我不知道为什么"跑步意味着"即使我改变了"对齐"时间序列也未正确对齐。在功能中。
时间序列是从1969年到2009年
这是我正在使用的数据:
structure(list(Year = 1961:2009, Rain = c(7.6656130268, 8.1981182796,
14.4514275121, 13.1530337942, 9.2569892473, 14.1592933948, 10.8212829069,
3.2401689708, 14.5850998464, 9.614093702, 13.1677048572, 4.7452764977,
20.7346774194, 9.3896697389, 21.9528735632, 22.5482334869, 6.0696620584,
7.100640041, 4.706154987, 7.9103302611, 9.9548387097, 8.0649001536,
6.2932888395, 3.8337173579, 23.5, 2.4107142857, 14.7172784575,
9.7700076805, 7.6785330261, 7.5453917051, 8.8073044123, 7.7576420891,
17.0896697389, 10.2380952381, 19.1981460882, 7.0900537634, 5.0630184332,
22.1928955453, 17.3850945495, 14.71593702, 12.7344086022, 6.0408602151,
8.0338524286, 7.1766513057, 21.8706989247, 10.6695852535, 21.4467185762,
10.5718894009, 3.9693548387)), .Names = c("Year", "Rain"), class =
"data.frame", row.names = c(NA,
-49L))
这是我的剧本:
dat<- read.csv("test.csv",header=TRUE,sep=",")
dat[dat == -999]<- NA
dat[dat == -888]<- 0
dat<-data.frame(dat)
dat$mav <- rollapply(dat$Rain,width=9,mean,fill=NA,align="right")
p <- ggplot(dat, aes(x = Year))
p <- p + geom_line(aes(y = Rain,color="test"))
p <- p + geom_point(aes(y = Rain,color="test"),size=1)
p <- p + geom_line(aes(y=mav, color = "9-year running mean") , lwd = 1)
p <- p + theme(panel.background=element_rect(fill="white"),
plot.margin = unit(c(0.5,0.5,0.5,0.5),"cm"),
panel.border=element_rect(colour="black",fill=NA,size=1),
axis.line.x=element_line(colour="black"),
axis.line.y=element_line(colour="black"),
axis.text=element_text(size=20,colour="black",family="serif"),
axis.title=element_text(size=15,colour="black",family="serif"),
legend.position = "top")
p <- p + scale_colour_manual(name="",values=c("test"="steelblue4","9-year running mean"="green"))
p <- p + scale_y_continuous(breaks=seq(0,50, by=10),limits=c(0,50), expand=c(0,0))
p <- p + scale_x_discrete(limits = c(seq(1961,2009,9)),expand=c(0,0))
p <- p + labs(x="Year",y="Rainfall(mm/day)")
我期待的是:
[a]运行平均值的时间序列应从1969开始,最后一个值应为2000.但在输出图像中,时间序列向右移动并在2009年结束。
[b]当我设置&#39;对齐&#39;到&#34;中心&#34;,运行平均值从1965年开始。
[c]有关如何在R中正确执行此操作的任何建议吗?
答案 0 :(得分:2)
我认为您可能误解了滚动应用中的宽度,填充和对齐方式。
vec <- 1:10
rollapply(vec, 5, mean, fill=NA, align='right')
# [1] NA NA NA NA 3 4 5 6 7 8
首先取n=5
个值并计算均值:
mean(vec[1:5])
# [1] 3
放在哪里?由于我们说align='right'
,它将它放在最右边的位置,因此索引为5。
# [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
# ^
# 3
并且由于您说fill=NA
,它会保留前面的空格并用NA
填充它们
# [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
# ^ ^ ^ ^
# [1] NA NA NA NA 3
对于下一次迭代,它取第2到第6位的平均值:
mean(vec[2:6])
# [1] 4
然后它位于第6位:
# [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
# ^
# [1] NA NA NA NA 3 4
当我们到达最后一次迭代时,我们通过len-n+1
(10)计算位置len
(10-5 + 1 = 6),所以
mean(vec[6:10])
# [1] 8
所以它被置于最后位置
# [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
# ^
# [1] NA NA NA NA 3 4 5 6 7 8
因此,由于我们有width=5
和fill=NA
,我们会在5-1=4
个空格中填充NA
。 (如果数据中还有NA
个,那么可能会有更多。)如果我们选择了width=5
而没有fill
,那么我们就会有5-1=4
个空格缺少,意思是
# [1] 3 4 5 6 7 8
如果我们完成width=5, fill=NA, align='left'
,那么我们应该看到:
rollapply(vec, 5, mean, fill=NA, align='left')
# [1] 3 4 5 6 7 8 NA NA NA NA
因为我们要求NA
删除副词,我们说每个宽度为5的窗口都将每个值放在最左边。最后一次迭代(mean(vec[6:10])
,值为8)被放在宽度为5的最后一个窗口的最左侧位置,这意味着右侧有四个空间,具有已知的未知值。