如何用扩展窗口计算平均值

时间:2014-10-09 14:10:40

标签: r rollapply

下面有一个数据框。我想知道如何计算列' value_t'的平均值。通过从2014-1-5'开始扩展窗口。例如val(1)= mean(1:5),value(2)= mean(1:6),value(3)= mean(1:7)。我希望算法是有效的(没有循环)。

df<-data.frame(date_t=paste('2014-01-',1:15,sep=""),value_t=1:15)
> df
   date_t        value_t
1   2014-01-1       1
2   2014-01-2       2
3   2014-01-3       3
4   2014-01-4       4
5   2014-01-5       5
6   2014-01-6       6
7   2014-01-7       7
8   2014-01-8       8
9   2014-01-9       9
10 2014-01-10      10
11 2014-01-11      11
12 2014-01-12      12
13 2014-01-13      13
14 2014-01-14      14
15 2014-01-15      15

3 个答案:

答案 0 :(得分:2)

sapply(5:NROW(df), function(.) mean(df$value_t[1:.]))怎么样?它涉及一种循环(sapply)但它应该是合理的快速。

答案 1 :(得分:1)

sapply(...)解决方案比for(...)循环快,但只是(大约2% - 在误差范围内)。事实证明,在每一步从数据框中提取列会大大减慢速度。如果您首先将该列作为向量获取,则可以获得约25%的改进。

df <- data.frame(value=1:1e4)
f.sapply <- function() sapply(5:nrow(df), function(.) mean(df$value[1:.]))
f.loop   <- function() {result <- numeric(nrow(df)-4)
                        for (i in 5:nrow(df)) result[i-4] <- mean(df$value[1:i])
                        result
}
f.vec    <- function() {vec<-df$value
                        sapply(5:nrow(df), function(.) mean(vec[1:.]))
}

# do they produce identical results?
identical(f.sapply(),f.loop())
# [1] TRUE
identical(f.sapply(),f.vec())
# [1] TRUE
# which is faster?
library(microbenchmark)
microbenchmark(f.sapply(),f.loop(),f.vec())
# Unit: milliseconds
#        expr      min       lq   median        uq      max neval
#  f.sapply() 904.2934 929.7361 947.7621  978.8775 1496.455   100
#    f.loop() 927.5288 950.3632 963.5926 1012.2407 1347.889   100
#     f.vec() 669.5615 697.3639 711.1498  751.2634 1060.056   100

答案 2 :(得分:0)

看看这个

df$val <- cumsum(df$value_t) / 1:nrow(df)
df$val[1:4] <- NA
#     date_t value_t val
#  2014-01-1       1  NA
#  2014-01-2       2  NA
#  2014-01-3       3  NA
#  2014-01-4       4  NA
#  2014-01-5       5 3.0
#  2014-01-6       6 3.5
#  2014-01-7       7 4.0
#  2014-01-8       8 4.5
#  2014-01-9       9 5.0
# 2014-01-10      10 5.5
# 2014-01-11      11 6.0
# 2014-01-12      12 6.5
# 2014-01-13      13 7.0
# 2014-01-14      14 7.5
# 2014-01-15      15 8.0

如果您只是想要矢量,并且您不想篡改df,请执行

val <- (cumsum(df$value_t) / 1:nrow(df))[-(1:4)]
# 3.0 3.5 4.0 4.5 5.0 5.5 6.0 6.5 7.0 7.5 8.0