我有一组数据,我用过scikit学习PCA。在使用StandardScaler()执行PCA之前,我缩放了数据。
variance_to_retain = 0.99
np_scaled = StandardScaler().fit_transform(df_data)
pca = PCA(n_components=variance_to_retain)
np_pca = pca.fit_transform(np_scaled)
# make dataframe of scaled data
# put column names on scaled data for use later
df_scaled = pd.DataFrame(np_scaled, columns=df_data.columns)
num_components = len(pca.explained_variance_ratio_)
cum_variance_explained = np.cumsum(pca.explained_variance_ratio_)
eigenvalues = pca.explained_variance_
eigenvectors = pca.components_
然后我在缩放的数据集上运行了K-Means聚类。我可以在缩放空间中绘制聚类中心。
我的问题是:如何将中心的位置转换回原始数据空间。我知道StandardScaler.fit_transform()使数据的均值和单位方差为零。但是使用新的形状点(num_clusters,num_features),我可以使用inverse_transform(中心)将中心转换回原始数据的范围和偏移量吗?
谢谢大卫
答案 0 :(得分:3)
你可以在kmeans上获得cluster_centers,然后将其推入你的pca.inverse_transform
这是一个例子
import numpy as np
from sklearn import decomposition
from sklearn import datasets
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
iris = datasets.load_iris()
X = iris.data
y = iris.target
scal = StandardScaler()
X_t = scal.fit_transform(X)
pca = decomposition.PCA(n_components=3)
pca.fit(X_t)
X_t = pca.transform(X_t)
clf = KMeans(n_clusters=3)
clf.fit(X_t)
scal.inverse_transform(pca.inverse_transform(clf.cluster_centers_))
请注意,sklearn有多种方法可以进行拟合/变换。您可以执行StandardScaler().fit_transform(X)
但是您丢失了缩放器,并且无法重复使用它;你也不能用它来创造一个逆。
或者,您可以scal = StandardScaler()
后跟scal.fit(X)
,然后scal.transform(X)
或者你可以scal.fit_transform(X)
结合适合/转换步骤