使用具有绘图功能的增强图将图形导出为R包中的graphml文件

时间:2018-04-16 18:56:11

标签: r igraph rcpp boost-graph graphml

我使用boost-graph开发了一个C ++程序,它将输出存储为graphml文件。

这使用了boost图库的编译部分。

我想使用Rcpp将此代码包含在R包中,因此我使用了BH,但是graphml编写器不包含在BH中。我补充一点,我想要包含一些简单的绘图功能。我想出的可能的解决方案是:

  • 编写graphml编写器,并将其与bioconductor上的图形包接口以进行绘图。
  • 使用igraph编写接口(无需编写解析器)
  • 还有其他解决方案吗?

我认为我会将第二个选项用于商品目的,但我想知道是否有人遇到过此问题/对此问题有意见?

我想将此包提交给bioconductor。

谢谢, 亚历

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