我有下面的数据和代码,非常感谢您帮助估算DIC
的{{1}}(或AIC
)与zoib
的回归模型:
library(zoib)
data("GasolineYield", package = "zoib")
re.md <- zoib(yield ~ temp | 1 | 1, data=GasolineYield,
joint = FALSE, random=1, EUID=GasolineYield$batch,
zero.inflation = FALSE, one.inflation = FALSE,
n.iter=3200, n.thin=15, n.burn=200)
sample2 <- re.md$coeff
summary(sample2)
根据作者发布的软件包vignette和article,我实施了以下代码以获取DIC
,但收到错误消息:
dic.samples(sample2, n.iter=201, thin = 1, type="pD")
Error in nchain(model) : Invalid JAGS model object in nchain
我使用coda.samples {rjags}
文档中的对象运行相同的代码并且它有效:
data(LINE)
LINE$recompile()
LINE.out <- coda.samples(LINE, c("alpha","beta","sigma"), n.iter=1000)
summary(LINE.out)
dic.samples(LINE, n.iter=201, thin = 1, type="pD")
然后我检查了LINE
,sample2
,re.md
和LINE.out
上方的每个对象的类,输出为:
class(LINE)
"jags"
class(re.md)
"list"
class(sample2)
"mcmc.list"
class(LINE.out)
"mcmc.list"
这表明我的错误可能是因为对象sample2
不属于jags
类。
因此,如果我能够sample2
以dic.samples
可以接受的形式获取DIC
以便能够获得AIC
(或{{1我的rd.md
模型。